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吉林省玉米种质资源SSR和SNP分子身份证的构建及应用
引用本文:
张茗起,王蕊,张春宵,孙擘,任洁,李淑芳,王璐,朱少喜,张江斌,施昕晨,王海杰,张云龙,田红丽,赵怡锟,匡猛,王元东,易红梅,李晓辉,王凤格.吉林省玉米种质资源SSR和SNP分子身份证的构建及应用[J].中国农业科学,2024(2):236-249.
作者姓名:
张茗起
王蕊
张春宵
孙擘
任洁
李淑芳
王璐
朱少喜
张江斌
施昕晨
王海杰
张云龙
田红丽
赵怡锟
匡猛
王元东
易红梅
李晓辉
王凤格
作者单位:
1. 北京市农林科学院玉米研究所/农业农村部农作物DNA指纹创新利用重点实验室(部省共建)/玉米DNA指纹及分子育种北京市重点实验室;2. 中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室;3. 吉林省农业科学院玉米研究所;4. 吉林省农业科学院作物资源研究所
基金项目:
国家重点研发计划(2021YFD1201005);
摘 要:
【目的】农作物种质资源具有重要的战略地位。吉林省玉米种质资源库主要存储具有北方春玉米区特色的种质资源。鉴于在传统农作物种质资源管理过程中难以获取真实身份信息的现状,利用分子标记技术构建种质资源分子身份证可以有效鉴定种质资源真实身份,强化种质资源的分类管理。通过深度发掘吉林省玉米种质资源库的优异资源,推动共享利用。【方法】以吉林省玉米种质资源库中的2 918份玉米种质资源为研究对象,采用玉米品种鉴定检测标准中推荐的40对SSR标记,以及61 214个SNP标记来构建其分子身份证。根据获得的分子身份证信息将种质资源划分为核心、同近源、异质和群体等类进行管理,并进一步针对核心种质进行遗传多样性分析。【结果】为2 918份种质资源构建了SSR分子身份证,为除异质性种质外的2 502份种质资源构建了SNP分子身份证。分别制定了玉米种质资源SSR和SNP分子身份证的建设规范。其中,SSR分子身份证由40个SSR位点指纹转化为三位数字和一位字母的编码组合构成,并以二维码形式存储;SNP分子身份证由61 214个SNP位点指纹转化为可视化的条形码。根据样品纯合度和指纹特异性等特征,将样品划分为1 56...
关 键 词:
玉米
种质资源
吉林
SSR
SNP
分子身份证
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