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皖北猪的随机扩增多态DNA研究
引用本文:王少兵,张俊宝,姚勇,谢京君,钱明明,车传燕,李光,缪士龙,阮跃.皖北猪的随机扩增多态DNA研究[J].畜牧与兽医,2013,45(4).
作者姓名:王少兵  张俊宝  姚勇  谢京君  钱明明  车传燕  李光  缪士龙  阮跃
作者单位:1. 安徽科技学院动物科学学院,安徽凤阳233100;芜湖职业技术学院生物工程系,安徽芜湖241000
2. 安徽亳州市畜牧局,安徽亳州,236800
3. 安徽科技学院动物科学学院,安徽凤阳,233100
4. 芜湖职业技术学院生物工程系,安徽芜湖,241000
基金项目:安徽科技厅科技人员服务企业计划项目,中央财政支持安徽省动物科学与技术专业建设专项经费(教职成,安徽省动物科学与技术特色专业(教高,芜湖职业技术学院自然科学研究项目
摘    要:为保护和开发地方品种猪的遗传资源,采用随机扩增多态DNA(RAPD)法分析皖北猪个体之间的遗传多样性。试验方案采用L(35)正交法,优化RAPD反应条件;筛选7条特异引物对皖北猪进行RAPD分析,计算带谱相似率、平均杂合度和遗传相似度,UPGMA法进行聚类分析。试验结果表明,优化的皖北猪RAPD反应体系为Mg2+浓度3 mmol/L,Taq酶1.50 U,dNTPs浓度0.40 mmol/L,引物浓度0.50μmol/L,模板浓度1 mg/L。皖北猪群处于亲缘关系不清的遗传非均衡状态。

关 键 词:皖北猪  RAPD  遗传差异  聚类分析

Randomly amplified polymorphic DNA of Wanbei pigs in the Northern Anhui Province
Abstract:For the protection and developement of local pig breeds,our current project investigates the genetic diversity between pig individuals in northern Anhui province by using random amplified polymorphic DNA(RAPD) and L(3 5) orthogonal design,screening RAPD reaction conditions.The seven specific primers are used for RAPD analysis of Wanbei pigs in northern Anhui province,calculating the similarity ratio of bands,the average heterozygosity and genetic similarity,constructing the phylogenetic tree using UPGMA.In conclusion,the optimal RAPD reaction system was developed as follows: 3mmol / L Mg 2 +,1.50U Taq DNA Polymerase,0.40mmol/L dNTPs,0.50μmol/L Specific primers,1mg / L DNA template.Genetic state of the pig herds is disequilibrium and no clear relationship between the individuals.
Keywords:Pig  RAPD  Genetic difference  Cluster analysis
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