| 东南亚62个籼型水稻亲本SSR遗传多样性分析 |
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| 引用本文： | 从夕汉,施伏芝,阮新民,张效忠,罗志祥.东南亚62个籼型水稻亲本SSR遗传多样性分析[J].核农学报,2016(5):859-868. |
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| 作者姓名： | 从夕汉 施伏芝 阮新民 张效忠 罗志祥 |
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| 作者单位： | 安徽省农业科学院水稻研究所/安徽省水稻遗传育种重点实验室,安徽合肥,230031 |
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| 基金项目： | 安徽省科技攻关计划项目(1604a0702008);安徽省自然科学基金项目(1608085QC67);国家科技支撑计划项目(2011CB117002 |
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| 摘 要： | 为探讨东南亚水稻亲本间的遗传多样性,以东南亚62份籼型水稻亲本为材料,选择29对水稻功能基因标记以及平均分布于12条染色体、多态性较高和条带清晰的72对SSR引物进行遗传多样性和聚类分析。结果表明,32对多态性引物在62份水稻材料中检测到201个等位基因,每个位点等位基因数(Na)变异范围为2~12,平均为6.281;有效等位基因数(Ne)变异范围为1.067~5.399,平均为2.867;多态信息含量(PIC)变异范围为0.061~0.789,平均为0.515;平均Shannon信息指数(I)为1.176,变幅为0.143~1.908;观察杂合度(Ho)为0.977,范围为0.936~1.000;期望杂合度(He)为0.439,范围为0.179~0.937;固定指数(Fis)的范围为0.882~1.000;基因流(Nm)的范围为0~0.0157。聚类分析表明,在遗传相似系数为0.805处,东南亚水稻亲本被分为6大类,同一国家大多数品种聚为一类。相对于普通分子标记,功能基因标记的平均等位基因数不高,其遗传多样性参数也低于普通分子标记,东南亚各国水稻品种间的亲缘关系较近,遗传多样性程度较低。研究结果为水稻育种亲本选配、新种质资源的创制以及杂种优势利用等提供了科学依据。
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| 关 键 词： | 水稻 功能基因 遗传多样性 SSR标记 |
Analysis of Genetic Diversity of 62 Indica Rice Parents From Southeast Asia Based on Microsatellite Marker |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | rice functional gene genetic diversity simple sequence repeat |
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