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犬细小病毒河南株的分离鉴定及全基因组序列分析
引用本文:唐磊,张弛,秦亚,孙浩杰,张楠,张百惠,蔡亚南,魏战勇.犬细小病毒河南株的分离鉴定及全基因组序列分析[J].河南农业科学,2019,48(5).
作者姓名:唐磊  张弛  秦亚  孙浩杰  张楠  张百惠  蔡亚南  魏战勇
作者单位:吉林农业大学,吉林 长春130118;河南农业大学,河南 郑州450002;河南农业大学,河南 郑州,450002;吉林农业大学,吉林 长春,130118
基金项目:国家自然科学基金;中国博士后科学基金面上项目
摘    要:为了研究河南省当前犬细小病毒(Canine parvovirus,CPV)的流行情况,收集经CPV胶体金试纸检测阳性的病犬血便病料,对其处理后进行特异性PCR扩增,然后将粪便处理物经滤器过滤后接种于F81细胞,进行细胞盲传并观察细胞的病变情况,同时对病毒进行理化性质及血凝试验等检测,最后对病毒的全基因组进行测序。结果表明,该病毒经特异性PCR扩增初步鉴定为CPV,接种于F81细胞盲传2代后,出现明显细胞病变。全基因组测序显示,该病毒分离株基因组全长5 052 bp,其中包含U型发卡结构188 bp,Y型发卡结构120 bp。此外,其ORF1全长2 007 bp,能够编码非结构蛋白NS1,ORF2全长2 257 bp,能够编码结构蛋白VP1、VP2。经VP2氨基酸序列分析,鉴定其为New CPV-2b亚型,命名为CPV/HN1,该病毒分离株TCID_(50)为10~(-4.85)/0.1 mL,血凝效价为1∶256。与国内的17株参考毒株全基因组序列核苷酸同源性为96.4%~99.9%,其中与北京分离毒株同源性为99.9%。

关 键 词:犬细小病毒  分离鉴定  全基因组测序  序列分析  河南省
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