紫茎泽兰叶绿体基因RNA编辑位点的鉴定及分析 |
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引用本文: | 吕萌荔,王梦醒,贾晓鸥,邓平川,聂小军,宋卫宁.紫茎泽兰叶绿体基因RNA编辑位点的鉴定及分析[J].西北农业学报,2015,24(2):127-133. |
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作者姓名: | 吕萌荔 王梦醒 贾晓鸥 邓平川 聂小军 宋卫宁 |
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作者单位: | 西北农林科技大学农学院 |
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基金项目: | “973计划”重要外来物种入侵的生态影响机制与监控基础(2009CB119201);植物病虫害生物学国家重点实验室开放课题(SKLOF201314);国家自然科学基金(31471825) |
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摘 要: | RNA编辑是陆生植物叶绿体转录后基因表达调控的一种重要方式。本试验以紫茎泽兰为材料,利用生物信息学预测结合分子克隆及测序方法对其叶绿体的RNA编辑位点进行预测和分析。结果共预测到分布于19个基因的42个编辑位点,所有位点均为C到U的转换。编辑位点的发生位置分析发现,8个位于密码子第1位,34个位于密码子第2位,而密码子第3位未发现RNA编辑事件。同时,利用RT-PCR方法对其中4个基因的编辑位点进行验证,鉴定发现10个真实发生的编辑位点。进一步分析这10个位点发生编辑后对其编码蛋白质跨膜结构域和二级结构的影响,结果表明,ndhB-467的编辑会引起蛋白质跨膜结构的增加,ndhB-149的编辑会引起蛋白质二级结构的改变。
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关 键 词: | 紫茎泽兰 叶绿体 RNA编辑 鉴定分析 |
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