| 蒺藜苜蓿全基因组抗病基因和基因扩张分析 |
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| 引用本文： | 赵阳,江海洋,汪结明,马伟,朱苏文,程备久.蒺藜苜蓿全基因组抗病基因和基因扩张分析[J].农业生物技术学报,2009,17(6). |
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| 作者姓名： | 赵阳 江海洋 汪结明 马伟 朱苏文 程备久 |
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| 作者单位： | 安徽农业大学作物生物学省重点实验室,合肥,230036 |
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| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划(863)项目，国家自然科学基金 |
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| 摘 要： | 利用BLAST(basic local alignment search tool)和HMM(hidden markov model)工具,对蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)全基因组Mt2.0数据中含有核苷酸结合位点(NBS)结构的抗病基因进行了分析,包括NBS基因数量、类型、基因复制、物理位置分析和系统进化树关系分析.结果表明,在苜蓿全基因组中找到469个含有NBS结构的抗病基因,其中包括446个标准结构NBS基因、23个非标准结构NBS基因.通过对全基因组内标准NBS类型抗病基因进行物理位置和基因家族分析,发现苜蓿基因组中抗病基因存在明显的基因复制现象,基因的复制对苜蓿基因组中NBS类型抗病基因数量扩张起到了重要的作用.
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| 关 键 词： | 苜蓿 核苷酸结合位点(NBS) 抗病基因 基因复制 生物信息学 |
Analyses of Genome-wide Disease Resistance Genes and Their Expansion in Medicago truncatula |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Medicago truncatula nucleotide-binding-site(NBS) disease resistance gene gene duplication bioinformatics |
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