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黄瓜液泡膜H+-PPass基因CuPPase的cDNA克隆、序列分析与表达
引用本文:洪艳艳,史庆华,王秀峰,窦宏伟,王双双,刘泽洲.黄瓜液泡膜H+-PPass基因CuPPase的cDNA克隆、序列分析与表达[J].园艺学报,2010,37(3):413-420.
作者姓名:洪艳艳  史庆华  王秀峰  窦宏伟  王双双  刘泽洲
作者单位:1. 山东农业大学园艺科学与工程学院,山东,泰安,271018
2. 山东农业大学园艺科学与工程学院,山东,泰安,271018;作物生物学国家重点实验室,山东,泰安,271018
3. 山东农业大学林学院,山东,泰安,271018
基金项目:国家'973'项目,国家自然科学基金,中国博士后科学基金 
摘    要: 利用GenBank 登录的植物液泡膜焦磷酸酶氨基酸保守区序列设计简并引物,利用RT-PCR 和RACE-PCR 技术从黄瓜叶片中获得了一个液泡膜H+-PPase 基因,命名为CuPPase,GenBank 注册号为GQ223786。CuPPase 蛋白与南瓜、绿豆同源性最高,分别为94%,92%。生物信息学分析表明,该基因全长2 650 bp,开放阅读框(ORF)2 307 bp,编码768 个氨基酸;CuPPase 蛋白大小约80 kD,理论pI值为5.32。该基因有14 个强的跨膜螺旋结构,PlantCare 分析结果显示该基因序列具有脱落酸诱导、生长素诱导、赤霉素诱导、水杨酸诱导、低温诱导、干旱诱导的顺式作用元件。RT-PCR 表明,CuPPase 在叶和根中表达较高,茎中表达较低。CuPPase表达受盐胁迫以及高温、低温胁迫诱导,但与处理时间有密切关系,其表达均表现先升高后降低的趋势。

关 键 词:黄瓜  cDNA  克隆  序列分析  表达

Cloning,Characterization and Expression of a H~+-PPase Gene CuPPase from Cucumis sativus L.
HONG Yan-yan,SHI Qing-hua,WANG Xiu-feng,DOU Hong-wei,WANG Shuang-shuang,LIU Ze-zhou.Cloning,Characterization and Expression of a H~+-PPase Gene CuPPase from Cucumis sativus L.[J].Acta Horticulturae Sinica,2010,37(3):413-420.
Authors:HONG Yan-yan  SHI Qing-hua  WANG Xiu-feng  DOU Hong-wei  WANG Shuang-shuang  LIU Ze-zhou
Institution:HONG Yan-yan1,SHI Qing-hua1,2,WANG Xiu-feng1,DOU Hong-wei3,WANG Shuang-shuang1,, LIU Ze-zhou1 (1College of Horticulture Science , Engineering,Sh,ong Agricultural University,Tai\'an,Sh,ong 271018,China,2State Key Laboratory of Crop Biology,3College of Forestry,China)
Abstract:Using PCR degenerate primers designed based on the conserved amino acid sequences of known tonoplast H+-PPase to amplify cDNA fragments from cucumber by RT-PCR and RACE-PCR,a H+-PPase gene named CuPPase was cloned.The CuPPase protein showed 94%,92% similarity to the H+-PPases from Cucurbita moschata and Vigna radiata.Bioinformatics analysis indicated that the full-length cDNA sequence was 2 650 bp,which contained an open reading frame of 2307 bp and encoded a protein of 768 amino acid residues with a calcul...
Keywords:cucumber  cDNA cloning  sequence analysis  expression
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