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仿刺参cDNA文库构建以及序列分析
引用本文:徐赛涛,丛丽娜,朱蓓薇.仿刺参cDNA文库构建以及序列分析[J].中国水产科学,2007,14(Z1).
作者姓名:徐赛涛  丛丽娜  朱蓓薇
基金项目:国家自然科学基金;国家重点基础研究发展计划(973计划)
摘    要:应用Gubler-Hoffman cDNA Library Construction技术,构建仿刺参(Apostichopus japonicus)cDNA文库.测试结果表明,库容量为2.0×106 pfu/mL,利用PCR方法检测cDNA文库插入DNA片段的大小,其长度范围在0.5~4.1 kb,插入片段平均长度为1.3kb,表明该文库达到建库要求,可用来筛选低丰度mRNA的基因克隆.随机挑选100个1kb以上的cDNA克隆进行测序分析,发现有25条EST序列和网上公布的其他物种的序列相似性较高,这些基因与刺参能量代谢和蛋白水解相关.其中发现的几个重要基因,如编码遍在蛋白以及缬酪肽蛋白等的基因,可能与仿刺参自溶过程的蛋白酶水解和细胞凋亡事件相关,进一步的研究还在进行.另有49条EST序列相似性较低,推测可能是功能未知的新基因.仿刺参cDNA文库的成功构建,为下一步大量EST序列分析和功能性新基因的发现,以及从基因水平认识仿刺参这一特殊棘皮动物的生长、发育和代谢规律奠定了基础.

关 键 词:仿刺参  cDNA文库  蛋白水解

Construction and analysis of cDNA library from the sea cucumber Stichopus japonicus
XU Sai-tao,CONG Li-na,ZHU Bei-wei.Construction and analysis of cDNA library from the sea cucumber Stichopus japonicus[J].Journal of Fishery Sciences of China,2007,14(Z1).
Authors:XU Sai-tao  CONG Li-na  ZHU Bei-wei
Abstract:
Keywords:
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