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中国黑白花奶牛干扰素-τ成熟蛋白基因的克隆与序列分析及牛干扰素-τ的分类
引用本文:张明,管晓斌,朱庆,刘学方,冯玉梅,赖松家.中国黑白花奶牛干扰素-τ成熟蛋白基因的克隆与序列分析及牛干扰素-τ的分类[J].畜牧兽医学报,2007,38(5):417-424.
作者姓名:张明  管晓斌  朱庆  刘学方  冯玉梅  赖松家
作者单位:四川农业大学动物科技学院,雅安,625014
基金项目:四川省教育厅“牛干扰素-τ多态性及其与繁殖性状的相关性研究”项目,四川农业大学动物遗传与繁殖重点学科博士点基金
摘    要:通过PCR克隆测序首次测定了黑白花奶牛干扰素-τ成熟蛋白的完整基因序列(GenBank登录号:DQ680846、DQ680847),其CDS长度为519 bp,编码含有172个氨基酸的牛干扰素-τ成熟蛋白。对所有牛干扰素-τ序列进行聚类分析,可将其聚为4类,发现了一类新的牛干扰素-τ(τ4)和6种新亚型(τ1e、τ3f、τ3g、τ3h、τ4a、τ4b)。DQ680846属于τ4类的一种亚型,标记为τ4a;DQ680847属于τ3类的一种亚型,标记为τ3f。各牛干扰素-τ基因核苷酸序列间的同源性在92.7%~99.8%之间,推导氨基酸序列间的同源性在88.5%~99.4%之间;τ4a、τ3f与其他牛干扰素-τ基因核苷酸序列间的同源性分别在94.0%~97.1%、92.9%~99.6%之间,推导氨基酸序列间的同源性分别在91.4%~96.0%、88.5%~99.4%之间。这一结果反应了牛干扰素-τ基因在进化过程中的高度保守性。二级结构预测发现牛干扰素-τ成熟蛋白是以5个α-螺旋(A-E螺旋)为基础构成的。Asn78、Cys1、Cys29、Cys99、Cys139I、le143、Lys160和C-末端的11个氨基酸为高度保守区,它们是维持牛干扰素-τ的结构和功能所必需的。

关 键 词:干扰素-τ  黑白花奶牛  分子克隆  序列分析  分类
文章编号:0366-6964(2007)05-0417-08
修稿时间:2006-10-13

Cloning and Sequence Analysis of Mature Interferon-τ Gene from Chinese Holstein and a Classification for Bovine Interferon-τ
ZHANG Ming,GUAN Xiao-bin,ZHU Qing,LIU Xue-fang,FENG Yu-mei,LAI Song-jia.Cloning and Sequence Analysis of Mature Interferon-τ Gene from Chinese Holstein and a Classification for Bovine Interferon-τ[J].Acta Veterinaria et Zootechnica Sinica,2007,38(5):417-424.
Authors:ZHANG Ming  GUAN Xiao-bin  ZHU Qing  LIU Xue-fang  FENG Yu-mei  LAI Song-jia
Institution:College of Animal Science and Technology, Sichuan Agricultural University, Yaan 625014, China
Abstract:
Keywords:
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