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猪源和鼠源脑心肌炎病毒分离株基因组的比较分析
引用本文:赵婷,张家龙,盖新娜,郭鑫,周磊,陈艳红,查振林,杨汉春.猪源和鼠源脑心肌炎病毒分离株基因组的比较分析[J].畜牧兽医学报,2009,40(6).
作者姓名:赵婷  张家龙  盖新娜  郭鑫  周磊  陈艳红  查振林  杨汉春
作者单位:中国农业大学动物医学院,农业部人畜共患病重点开放实验室,北京,100193
基金项目:国家自然科学基金,教育部长江学者和创新团队发展计划 
摘    要:为了分析猪源和鼠源脑心肌炎病毒(EMCV)基因组的差异,对分离自同一猪场猪临床样本和鼠组织样本的2株病毒(GX0601和GX0602)进行了全基因组序列测定和比较分析.结果显示,2个分离毒株的基因组全长(包含poly A)分别为7 729和7 725 nt,核苷酸和氨基酸同源性均在99.8%以上.与国外毒株及国内已报道的分离株的序列比较结果表明,2个毒株与BJC3和HBl的核苷酸同源性为98.18%~99.41%,推导的氨基酸序列同源性为99.5%~99.7%,与国外分离株的核苷酸序列和氨基睃序列的同源性分别介于80.53%~99.57%和93.1%~99.5%.基于基因组开放阅读框推导的氨基酸序列的系统进化分析表明,我国分离毒株与国外毒株PEC9、CBNU、BEL-2887A/91和EMCV-R的同源性较高,位于同一个亚群.研究结果提示,猪源与鼠源毒株的基因组具有很高的同源性,鼠是猪场EMCV感染的传染来源.

关 键 词:脑心肌炎病毒  猪源和鼠源毒株  基因组  序列测定  进化分析

Comparative Analysis of the Genomes of Encephalomyocarditis Virus Isolates from Porcine and Mouse Origin
ZHAO Ting,ZHANG Jia-long,GE Xin-na,GUO Xin,ZHOU Lei,CHEN Yan-hong,ZHA Zhen-lin,YANG Han-chun.Comparative Analysis of the Genomes of Encephalomyocarditis Virus Isolates from Porcine and Mouse Origin[J].Acta Veterinaria et Zootechnica Sinica,2009,40(6).
Authors:ZHAO Ting  ZHANG Jia-long  GE Xin-na  GUO Xin  ZHOU Lei  CHEN Yan-hong  ZHA Zhen-lin  YANG Han-chun
Abstract:
Keywords:
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