| 新型鸭呼肠孤病毒QY株σB蛋白基因特征、二级结构预测及其细胞抗原表位分析 |
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| 引用本文： | 吴阳开,范文胜,张雪莲,李智丽,郭锦玥,李文锋,黄淑坚.新型鸭呼肠孤病毒QY株σB蛋白基因特征、二级结构预测及其细胞抗原表位分析[J].中国畜牧兽医,2019,46(10):2851-2859. |
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| 作者姓名： | 吴阳开 范文胜 张雪莲 李智丽 郭锦玥 李文锋 黄淑坚 |
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| 作者单位： | 1. 广东容大生物股份有限公司, 清远 511517;2. 广西大学动物科学技术学院, 南宁 530005;3. 佛山科学技术学院生命科学与工程学院, 佛山 528231 |
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| 基金项目： | 广东省水禽产业技术体系创新团队项目；广东省教育厅预防兽医学重点实验室项目（2014KTSPT037）；佛山科学技术学院动物新发疫病防控重点实验室开放基金（KLPREAD201801-08） |
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| 摘 要： | 本研究旨在对新型鸭呼肠孤病毒（NDRV）QY株σB蛋白的遗传变异规律和结构及功能进行分析。从GenBank数据库中获取QY株和25株参考株的σB蛋白编码序列，通过Mega 6.0软件进行序列比对分析和系统进化树构建；使用Datamonkey软件进行选择压力分析；运用生物信息学软件预测QY株σB蛋白二级结构功能及B细胞和T细胞抗原表位。相似性分析结果显示，NDRV QY株与国内其他地区分离的鸭呼肠孤病毒（DRV）氨基酸相似性达到94.9%~98.9%，与禽呼肠孤病毒（ARV）及番鸭呼肠孤病毒（MDRV）的相似性仅为66.5%~68.4%和67.6%~68.4%；选择压力分析显示，σB蛋白承受净化选择压力，但存在一个正向选择位点；σB蛋白属于亲水蛋白，不具有信号肽和跨膜区，含有潜在的O-糖基化位点；结构预测分析显示，σB蛋白具有α-螺旋、β-折叠、β-转角及无规则卷曲等丰富的二级结构；表位分析显示，σB蛋白含有潜在的B细胞和T细胞抗原表位。本研究成功进行了QY株σB蛋白的基因特征和结构功能预测及其细胞表位分析，为深入了解该蛋白的免疫学特性及研发NDRV新型疫苗奠定了基础。
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| 关 键 词： | 新型鸭呼肠孤病毒(NDRV) σB蛋白 基因特征 二级结构 抗原表位 |
| 收稿时间： | 2019-03-28 |
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