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| 德州驴与泌阳驴睾丸组织mRNA与microRNA表达鉴定与分析 | |
| 引用本文： | 韩浩园,李婉涛,雷初朝.德州驴与泌阳驴睾丸组织mRNA与microRNA表达鉴定与分析[J].中国畜牧兽医,2019,46(8):2371-2380. |
| 作者姓名： | 韩浩园 李婉涛 雷初朝 |
| 作者单位： | 1. 河南牧业经济学院动物科技学院, 郑州 450046; 2. 西北农林科技大学动物科技学院, 杨凌 712100; 3. 河南省畜禽遗传保护工程技术研究中心, 郑州 450046 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金（81270439） |
| 摘 要： | 试验旨在探究驴睾丸组织中mRNA和microRNA的表达模式，为中国地方驴的转录组研究提供遗传数据。利用RNA-Seq和生物信息学方法分析了中国地方驴睾丸组织表达基因和microRNA，并分析了泌阳驴和德州驴品种间差异表达基因及microRNA。结果表明，mRNA平均clean reads为57837506条，Small RNA平均clean reads为9952015条，分别占原始数据的96.34%和88.86%。在驴睾丸组织中共发现24751个表达基因及1074个表达microRNAs，其中，睾丸组织表达量较高的基因为LOC106836782、XLOC_066401、HSP90AA1、TNP1和COF2，表达量最高的microRNAs为eca-miR-143、eca-miR-21、eca-miR-99a、eca-miR-148a和eca-miR-26a。对泌阳驴与德州驴睾丸组织进行差异表达分析共发现102个差异表达基因及2个差异表达microRNAs，但未富集到功能条目，说明泌阳驴和德州驴品种间差异不明显。本研究提供了驴睾丸组织mRNA及microRNA表达模式和转录组学数据，并鉴定了泌阳驴与德州驴睾丸组织的差异表达mRNA和microRNA，对驴的遗传资源研究具有一定的科学意义。 |
| 关 键 词： | 驴 睾丸 转录组 差异表达基因 microRNA |
| 收稿时间： | 2018-12-19 |
Identification and Analysis of mRNA and microRNA Expression of Testis Tissue in Dezhou and Biyang Donkeys |
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| HAN Haoyuan,LI Wantao,LEI Chuzhao.Identification and Analysis of mRNA and microRNA Expression of Testis Tissue in Dezhou and Biyang Donkeys[J].China Animal Husbandry & Veterinary Medicine,2019,46(8):2371-2380. | |
| Authors: | HAN Haoyuan LI Wantao LEI Chuzhao |
| Institution: | 1. College of Animal Science and Technology, Henan University of Animal Husbandry and Economy, Zhengzhou 450046, China; 2. College of Animal Science and Technology, Northwest A & F University, Yangling 712100, China; 3. Henan Genetic Protection Engineering Research Center for Livestock and Poultry, Zhengzhou 450046, China |
| Abstract: | |
| Keywords: | |
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