| 水牛PPARG来源环状RNA的鉴定及表达谱分析 |
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| 引用本文： | 冯雪,洪慧颖,孙晓菲,亐开兴,黄必志,魏雪锋,马云,黄洁萍.水牛PPARG来源环状RNA的鉴定及表达谱分析[J].中国畜牧兽医,2019,46(12):3457-3465. |
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| 作者姓名： | 冯雪 洪慧颖 孙晓菲 亐开兴 黄必志 魏雪锋 马云 黄洁萍 |
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| 作者单位： | 1. 信阳师范学院生命科学学院, 信阳 464000;2. 云南省草地动物科学研究院, 昆明 650212 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金青年项目（31702094）；河南省高校重点项目（18A230013） |
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| 摘 要： | 为鉴定前期转录组测序分析结果的可靠性，并从中挖掘水牛脂肪沉积潜在环状RNA（circular RNA，circRNA），本研究对10个来源于过氧化物酶体增殖物激活受体γ（PPARG）基因的circRNA进行鉴定，根据测序获得的候选circRNA序列信息，设计对向引物进行半定量检测和普通测序以获得真实存在的circRNA，采用实时荧光定量PCR分析其在水牛不同组织和不同部位脂肪组织中的表达谱，半定量检测其在不同物种间的保守性。结果显示，10个候选circRNA中，有5个circRNA可以检测到，测序验证序列与转录组测序分析获得的序列一致，其中2个circRNA可设计出特异性的定量引物，这2个circRNA主要在脂肪组织中表达，且在不同部位脂肪组织中的表达量存在差异；另外3个circRNA在黄牛、牦牛、猪和小鼠的脂肪组织中均有表达，序列长度一致，序列相似度高。以上研究结果提示，转录组测序分析获得的结果可靠，其中有2个circRNA主要在脂肪组织中表达，且物种间保守，可作为研究水牛脂肪沉积的候选基因。
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| 关 键 词： | 水牛 PPARG基因 环状RNA 鉴定 表达谱 |
| 收稿时间： | 2019-02-26 |
Identification and Expression Profile Analysis of PPARG-derived Circular RNA in Buffalo |
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| FENG Xue,HONG Huiying,SUN Xiaofei,QU Kaixing,HUANG Bizhi,WEI Xuefeng,MA Yun,HUANG Jieping.Identification and Expression Profile Analysis of PPARG-derived Circular RNA in Buffalo[J].China Animal Husbandry & Veterinary Medicine,2019,46(12):3457-3465. |
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| Authors: | FENG Xue HONG Huiying SUN Xiaofei QU Kaixing HUANG Bizhi WEI Xuefeng MA Yun HUANG Jieping |
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| Institution: | 1. College of Life Science, Xinyang Normal University, Xinyang 464000, China;2. Academy of Grassland and Animal Science, Kunming 650212, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | buffalo PPARG gene circular RNA identification expression profile |
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