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天柱番鸭NPY基因克隆及其在组织中的表达分析
引用本文:谭斌,杨胜林,杨汝才,周璇,杨世皓,罗林丽,祝永才.天柱番鸭NPY基因克隆及其在组织中的表达分析[J].中国畜牧兽医,2019,46(4):967-976.
作者姓名:谭斌  杨胜林  杨汝才  周璇  杨世皓  罗林丽  祝永才
作者单位:1. 贵州大学动物科学学院, 贵阳 550025;
2. 高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室, 贵阳 550025
基金项目:贵州省科技厅成果应用与产业化计划(黔科合成果[2017]4110、黔科合成果[2018]4301);贵州省科技厅科技支撑计划(黔科合NY[2015]3006-2、黔科合支撑[2017]2539);贵州省普通本科高等学校科技成果转化与产业化(黔教合KY字[2017]056)
摘    要:试验旨在克隆天柱番鸭神经肽Y(neuropeptide Y,NPY)基因,并分析其在天柱番鸭不同组织中的转录水平。以天柱番鸭产蛋期组织混合cDNA为模板,通过RT-PCR扩增天柱番鸭NPY基因的完整CDS区进行克隆测序,并结合生物信息学分析工具分析其同源性及遗传进化关系,同时进行NPY蛋白理化特性、亚细胞定位、信号肽、糖基化与磷酸化位点、二级结构、三级结构等预测,并对NPY基因在天柱番鸭不同组织中的转录水平进行检测。结果表明,天柱番鸭NPY基因CDS区全长294 bp,编码97个氨基酸,核苷酸序列与氨基酸序列同源性比对显示,NPY基因在不同物种间具有一定的遗传多样性,与绿头鸭亲缘关系最近;NPY蛋白为酸性不稳定蛋白,存在1个信号肽(第1-28位氨基酸),亚细胞定位为100%位于细胞外;存在1个功能结构域PAH,同时含有2个O-糖基化和丰富的磷酸化位点,空间结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。实时荧光定量PCR结果表明,NPY基因mRNA在天柱番鸭各组织中均有分布,在大脑中表达水平相对较高,在胰腺、腺胃中表达量次之,与其他组织间差异极显著(P<0.01),在肌胃中表达量最低。本试验结果为进一步研究NPY基因在调控家禽能量平衡、生长发育、脂肪沉积、繁殖性能等多种生理功能提供了参考。

关 键 词:天柱番鸭  NPY基因  克隆  生物信息学分析  组织表达
收稿时间:2018-11-28

Cloning and Expressing Analysis of NPY Gene of Different Tissues in Tianzhu Muscovy
TAN Bin,YANG Shenglin,YANG Rucai,ZHOU Xuan,YANG Shihao,LUO Linli,ZHU Yongcai.Cloning and Expressing Analysis of NPY Gene of Different Tissues in Tianzhu Muscovy[J].China Animal Husbandry & Veterinary Medicine,2019,46(4):967-976.
Authors:TAN Bin  YANG Shenglin  YANG Rucai  ZHOU Xuan  YANG Shihao  LUO Linli  ZHU Yongcai
Institution:1. College of Animal Science, Guizhou University, Guiyang 550025, China;
2. Key Laboratory of Animal Genetics, Breeding and Reproduction in the Plateau Mountainous Region, Ministry of Education, Guiyang 550025, China
Abstract:
Keywords:Tianzhu muscovy  NPY gene  cloning  bioinformatics analysis  tissues expression  
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