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亚洲棉全基因组KNOX基因家族鉴定及组织表达分析
引用本文:孙润润,王园园,郭新磊,秦腾飞,张金宝,金翠萍,董涛,王清连.亚洲棉全基因组KNOX基因家族鉴定及组织表达分析[J].中国棉花,2019,46(12):15-22.
作者姓名:孙润润  王园园  郭新磊  秦腾飞  张金宝  金翠萍  董涛  王清连
作者单位:1.河南科技学院,现代生物育种河南省协同创新中心,河南 新乡 453003;2.中国农业科学院蔬菜花卉研究所,北京100081
摘    要:为探究亚洲棉KNOX基因家族特征及进化关系,本研究在石系亚1号中鉴定到23个KNOX基因(GaKNOX1-GaKNOX23)。23个基因定位于11条染色体上。除GaKNOX6、GaKNOX13、GaKNOX15、GaKNOX20和GaKNOX23外,其他GaKNOX蛋白均含有KNOX1、KNOX2、ELK和HOX 4个典型结构域。GaKNOX基因进化聚类形成两大分支:ClassⅠ和ClassⅡ。转录组数据分析显示,GaKNOX12在开花后20 d的纤维和胚珠中的表达量最高,说明它可能参与调控棉纤维次生壁形成过程。本研究在亚洲棉全基因组水平上鉴定KNOX基因家族并进行生物信息学分析,为进一步研究KNOX基因在棉花中的调控作用奠定基础。

关 键 词:亚洲棉  KNOX基因" target="_blank">KNOX基因')">KNOX基因  进化分析  基因结构  组织表达
收稿时间:2019-11-11

Genome-Wide Identification and Expression Analysis of KNOX Genes Familyin Gossypium arboreum
Sun Runrun,Wang Yuanyuan,Guo Xinlei,Qin Tengfei,Zhang Jinbao,Jin Cuiping,Dong Tao,Wang Qinglian.Genome-Wide Identification and Expression Analysis of KNOX Genes Familyin Gossypium arboreum[J].China Cotton,2019,46(12):15-22.
Authors:Sun Runrun  Wang Yuanyuan  Guo Xinlei  Qin Tengfei  Zhang Jinbao  Jin Cuiping  Dong Tao  Wang Qinglian
Abstract:
Keywords:
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