| 鼠伤寒沙门菌小RNA GcvB靶基因的预测与验证 |
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| 引用本文： | 潘永,刘丽娟,杨阳,李晨,马光强,杨琦.鼠伤寒沙门菌小RNA GcvB靶基因的预测与验证[J].畜牧兽医学报,2020,51(4):894-898. |
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| 作者姓名： | 潘永 刘丽娟 杨阳 李晨 马光强 杨琦 |
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| 作者单位： | 1. 贵州大学动物科学学院, 贵阳 550025;2. 贵州大学动物疫病研究所, 贵阳 550025;3. 贵州省动物疫病与兽医公共卫生重点实验室, 贵阳 550025;4. 贵州省畜禽资源遗传管理站, 贵阳 550025;5. 都匀市农业农村局, 都匀 558000;6. 黔南民族职业技术学院, 都匀 558000 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金（31760740；31602065）；贵州省科技厅联合资金项目贵州大学2017年度学术新苗培养及创新探索专项（黔科合LH字［2017］7263；黔科合平台人才［2017］5788）；贵州省科技厅基金（黔科合基础［2016］1047）；贵州省研究生教育创新计划项目（GZZ2017002） |
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| 摘 要： | 为筛选鼠伤寒沙门菌小RNA GcvB调控的靶基因,本研究通过TargetRNA2软件预测能与GcvB R1、R2和R3区产生作用的基因,将鼠伤寒沙门菌gcvB基因敲除株的转录组测序结果注释到KEGG数据库以及GO富集分析,并利用荧光定量PCR对预测的靶基因进行验证。TargetRNA2的预测结果显示,杂交能量最高的narY、yeaK、trpB和STM2732基因均能够和小RNA GcvB产生至少7个连续的碱基互补,narY、yeaK和trpB基因分别与鼠伤寒沙门菌无氧呼吸、脯氨酸与tRNA的识别以及色氨酸的合成相关。荧光定量PCR检测结果显示,narY、yeaK、trpB和STM2732基因在gcvB基因敲除条件下转录水平分别上调3.4、9.8、12.1和18.37倍。以上结果表明,narY、yeaK、trpB和STM2732基因受小RNA GcvB的负调控且可能为直接负调控。本研究为进一步探明小RNA GcvB与靶基因相互作用、小RNA的调控机制以及沙门菌致病机制奠定了基础。
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| 关 键 词： | 沙门菌 小RNA GcvB 转录组测序 靶基因 |
| 收稿时间： | 2019-11-01 |
Prediction and Validation of Small RNA GcvB Target Gene of Salmonella Typhimurium |
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| PAN Yong,LIU Lijuan,YANG Yang,LI Chen,MA Guangqiang,YANG Qi.Prediction and Validation of Small RNA GcvB Target Gene of Salmonella Typhimurium[J].Acta Veterinaria et Zootechnica Sinica,2020,51(4):894-898. |
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| Authors: | PAN Yong LIU Lijuan YANG Yang LI Chen MA Guangqiang YANG Qi |
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| Institution: | 1. College of Animal Science, Guizhou University, Guiyang 550025, China;2. Institute of Animal Diseases, Guizhou University, Guiyang 550025, China;3. Guizhou Key Laboratory of Animal Diseases and Veterinary Public Health, Guiyang 550025, China;4. Guizhou Province Livestock and Poultry Resource Genetic Management Station, Guiyang 550025, China;5. Agriculture and Rural Affairs Bureau of Duyun City, Duyun 558000, China;6. Qiannan National Vocational and Technical College, Duyun 558000, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | |
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