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鸡HMIT基因的克隆与表达分析
引用本文:杜鹏飞,陈博,高林歌,朱瑶,张向丽,朱星浩,陈文,黄艳群.鸡HMIT基因的克隆与表达分析[J].畜牧兽医学报,2020,51(8):1811-1822.
作者姓名:杜鹏飞  陈博  高林歌  朱瑶  张向丽  朱星浩  陈文  黄艳群
作者单位:河南农业大学 饲料营养河南省工程实验室, 郑州 450002
基金项目:智汇郑州.1125聚才计划-创新领军人才项目
摘    要:旨在克隆鸡H+/肌醇转运蛋白(H+/myoinositol transporter,HMIT)基因的转录序列,并检测HMIT基因在鸡不同组织中的表达情况,以及外源胰岛素处理对HMIT基因相对表达量的影响。本研究以AA肉鸡为试验动物,采用RT-PCR技术克隆鸡HMIT基因全编码区序列,采用生物信息学技术分析其编码蛋白的生物学特性,利用荧光定量PCR检测HMIT基因在大脑、肝、腹脂、腿肌、心、肾、空肠和回肠等组织中的表达情况,并检测其在肾和大脑中进行胰岛素处理120和240 min后的表达情况。结果表明,以NCBI预测的鸡HMIT(XM_001232939.5)序列为模板设计引物,成功克隆出鸡HMIT基因(1 694 bp,GenBank登录号:MN708211)。克隆的鸡HMIT编码区全长1 380 bp,相比XM_001232939.5预测的编码序列少561 bp,预测编码含有459个氨基酸组成的蛋白。核苷酸和氨基酸序列比对发现,鸡HMIT在物种间高度同源,共线性分析显示,HMIT所在的1号染色体区域在物种间也是高度保守的。HMIT编码的蛋白质是一种不稳定的亲水性蛋白质,其二级结构和三级结构以无规则卷曲和α-螺旋为主。跨膜结构分析显示,鸡HMIT存在8个明显的跨膜结构域。亚细胞定位结果表明,鸡HMIT蛋白分布于质膜(52.3%)、内质网(21.7%)、液泡(17.4%)、线粒体(4.3%)和高尔基体(4.3%)。实时荧光定量PCR检测结果显示,HMIT基因在鸡大脑和肾表达量最高,且显著高于其他组织(P<0.05)。胰岛素处理240 min后,HMIT在肾和大脑中的表达量都显著低于PBS对照组(P<0.05)。本研究克隆获得了鸡HMIT的全编码区,生物信息学分析及组织表达特性研究为深入探索鸡HMIT基因的生理功能和调控机制奠定基础。

关 键 词:HMIT  基因克隆  生物信息学分析  组织表达  胰岛素  
收稿时间:2019-12-16

Cloning and Expression Analysis of Chicken HMIT Gene
DU Pengfei,CHEN Bo,GAO Lin'ge,ZHU Yao,ZHANG Xiangli,ZHU Xinghao,CHEN Wen,HUANG Yanqun.Cloning and Expression Analysis of Chicken HMIT Gene[J].Acta Veterinaria et Zootechnica Sinica,2020,51(8):1811-1822.
Authors:DU Pengfei  CHEN Bo  GAO Lin'ge  ZHU Yao  ZHANG Xiangli  ZHU Xinghao  CHEN Wen  HUANG Yanqun
Institution:Feed Nutrition Engineering Laboratory of Henan Province, Henan Agricultural University, Zhengzhou 450002, China
Abstract:
Keywords:HMIT  gene cloning  bioinformatics analysis  tissue expression  insulin  
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