| 亚洲棉短绒突变体纤维发育及其差异基因表达分析 |
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| 引用本文： | 王晓阳,王丽媛,潘兆娥,何守朴,王骁,龚文芳,杜雄明.亚洲棉短绒突变体纤维发育及其差异基因表达分析[J].作物学报,2020,46(5):645-660. |
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| 作者姓名： | 王晓阳 王丽媛 潘兆娥 何守朴 王骁 龚文芳 杜雄明 |
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| 作者单位： | 中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室;棉花生物学国家重点实验室郑州研究基地/郑州大学;中南林业科技大学/经济林培育与保护教育部重点实验室 |
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| 基金项目： | This study was supported by the National Natural Science Foundation of China(31601353);the National Key Technology R&D Program(2017YFD0101601-03) |
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| 摘 要： | 棉花纤维是重要的天然纺织材料,是最长的单细胞,是研究纤维发育的良好材料。本研究以亚洲棉短绒突变体(FZ)及其野生型(fz)为材料,结合扫描电镜、石蜡切片、RNA-seq技术,解析棉花短绒起始的可能机制。与野生型(fz)的0DPA时期胚珠相比,突变体的胚珠在该时期仅有少量的纤维起始。在+3DPA时,突变体没有短绒细胞起始,仅有长纤维细胞,而野生型有大量的短纤维细胞和长纤维细胞。对这2个材料的0DPA、+3DPA、+5DPA和+8DPA胚珠差异基因分析结果显示,在短绒突变体(FZ)和野生型(fz)的4个纤维发育时期共挖掘出3780个差异表达基因,其中0DPA时差异基因数目最少,随着胚珠发育时间的延长,差异基因的数目逐渐增加。KEGG分析发现这些基因主要参与蜡质、角质生物合成,以及苯丙烷代谢和植物信号传导过程。共表达趋势分析显示,在突变体+3DPA上调的差异基因中,参与离子结合、MAPK级联反应、氧化还原活性和转录调控的基因表达受到正影响(表达水平提高),造成突变体短绒纤维不能正常起始。这些结果描述了二倍体亚洲棉短绒起始的动态变化,可为进一步研究棉纤维发育提供参考。
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| 关 键 词： | 亚洲棉 短绒突变体 差异表达基因 共表达趋势 |
| 收稿时间： | 2019-09-02 |
Analysis of differentially expressed genes and fiber development in Gossypium arboreum fuzzless mutant |
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| Xiao-Yang WANG,Li-Yuan WANG,Zhao-E PAN,Shou-Pu HE,Xiao WANG,Wen-Fang GONG,Xiong-Ming DU.Analysis of differentially expressed genes and fiber development in Gossypium arboreum fuzzless mutant[J].Acta Agronomica Sinica,2020,46(5):645-660. |
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| Authors: | Xiao-Yang WANG Li-Yuan WANG Zhao-E PAN Shou-Pu HE Xiao WANG Wen-Fang GONG Xiong-Ming DU |
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| Institution: | 1.Institute of Cotton Research, Chinese Academy of Agricultural Sciences / State Key Laboratory of Cotton Biology, Anyang 455000, Henan, China;2.Zhengzhou Research Base, State Key Laboratory of Cotton Biology / Zhengzhou University, Zhengzhou 450001, Henan, China;3.Key Laboratory of Cultivation and Protection for Non-wood Forest, Ministry of Education / Central South University of Forestry and Technology, Changsha 410004, Hunan, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Gossypium arboreum fuzzless mutant differentially expressed gene co-expressed trend |
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