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奥利亚罗非鱼β-actin基因的克隆与结构分析
引用本文:胡海彦,贾永义,唐永凯.奥利亚罗非鱼β-actin基因的克隆与结构分析[J].上海水产大学学报,2011(2).
作者姓名:胡海彦  贾永义  唐永凯
作者单位:中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部水生动物遗传育种和养殖生物学重点开放实验室;浙江省淡水水产研究所;
基金项目:现代农业产业技术体系建设专项资金(nycytx-49); 基本科研业务费专项资金(2011JBFC09)
摘    要:β-actin在真核细胞的生理过程中起着重要作用,其序列具有高度保守性,是一种管家基因。通过RT-PCR方法克隆出奥利亚罗非鱼(Oreochromis aureus)β-actin的部分cDNA序列,其长度为424 bp,翻译成138个氨基酸,计算的蛋白质分子量为15.5 ku。氨基酸同源性分析显示,奥利亚罗非鱼β-actin与真鲷(Pagrus major)、斑马鱼(Danio rerio)、青鳉(Oryzias latipes)、龙溪鳉(Rivulus marmoratus)的相似性最高,为99.3%;与鲫(Carassius auratus)、红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)等其它鱼的相似性也较高,为97.8%~98.6%。此外,还克隆出了奥利亚罗非鱼β-actin相应的DNA序列,共619 bp。cDNA和DNA的序列比对显示克隆出的奥利亚罗非鱼β-actin含有2个内含子,这为将来设计β-actin荧光定量PCR引物以及测定其在不同组织中的表达量变化打下基础。

关 键 词:奥利亚罗非鱼  β-actin  克隆  
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