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| 应用Illumina高通量测序技术分析中华真地鳖肠道微生物多样性 | |
| 引用本文： | 冯飞斐,王一丁.应用Illumina高通量测序技术分析中华真地鳖肠道微生物多样性[J].江苏农业科学,2018(4). |
| 作者姓名： | 冯飞斐 王一丁 |
| 作者单位： | 四川师范大学生命科学学院; |
| 摘 要： | 为了调查中华真地鳖肠道微生物多样性,应用Illumina高通量测序技术测定3个中华真地鳖肠道样本中微生物的16S r DNA-V4变异区序列,采用UPARSE等软件分析和统计样品中的操作分类单元(OTU)数量,并进行聚类分析,计算肠道微生物物种丰度。物种多样性分析显示,OTU数量为1 602~1 852个。3个样本中共检测到31个菌门,其中优势菌门是拟杆菌门、厚壁菌门和变形菌门;共检测到309个菌属,优势菌属是Parabacteroides、Alistipes、沙雷氏菌属、Christensenellaceae R-7 group、乳酸杆菌属、Candidatus Symbiothrix、Clostridium sensu stricto 1。 |
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