生物信息学方法在探究新出现流感病毒来源上的应用 |
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引用本文: | 马福健,兰德松,孟潇,杨继杰,丛晶晶.生物信息学方法在探究新出现流感病毒来源上的应用[J].现代畜牧兽医,2012(7):71-73. |
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作者姓名: | 马福健 兰德松 孟潇 杨继杰 丛晶晶 |
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作者单位: | 1. 辽宁省沈阳市于洪区造化动物卫生防疫监督所,辽宁沈阳,110000 2. 辽宁省动物疫病预防控制中心,辽宁沈阳,110164 |
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摘 要: | 2009年,墨西哥和美国发生新型猪源H1N1流感,造成全球性流行将近1年。流感病毒基因组由8个片段组成,基因重排是该病毒进化的主要动力。在探究一个新出现流感病毒株的重排进化起源时,利用生物信息学方法对所有片段的来源进行比对,如果其中的几个片段与某一个亲本毒株具有高度同源性,与另一个亲本毒株具有较低同源性,而剩余的几个片段则正好相反,我们就能推测这株新出现的流感病毒可能为这两个亲本毒株基因重排产生的杂合株。本文尝试用这种方法探索2009A/H1N1流感病毒多水平基因重排进化的来源。通过进一步证实这种方法的可靠性,表明这种方法可能在今后探究新出现流感病毒的重排来源上发挥重要作用。
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关 键 词: | 流感病毒 重排 来源 |
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