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冷冻原肠浸泡解冻池水细菌多样性分析
引用本文:仇保丰,宋鸿雁,董蓉莲,高雪梅,蒋荧梅,顾炳泉,胡顺林.冷冻原肠浸泡解冻池水细菌多样性分析[J].动物医学进展,2017,38(5).
作者姓名:仇保丰  宋鸿雁  董蓉莲  高雪梅  蒋荧梅  顾炳泉  胡顺林
作者单位:1. 扬州大学江苏省动物预防医学重点实验室,江苏扬州225009;南通出入境检验检疫局,江苏南通226004;2. 扬州大学江苏省动物预防医学重点实验室,江苏扬州225009;南通大学实验动物中心,江苏南通226001;3. 江苏省疾病预防控制中心,江苏南京,210009;4. 南通出入境检验检疫局,江苏南通,226004;5. 南通大学实验动物中心,江苏南通,226001;6. 扬州大学江苏省动物预防医学重点实验室,江苏扬州,225009
基金项目:江苏省动物预防医学重点实验室开放课题项目,南通市科技项目,江苏检验检疫局科研项目
摘    要:为了研究冷冻原肠浸泡解冻池水的细菌多样性,采集3份水样直接提取细菌基因组总DNA,再分别用PCR技术扩增出细菌16S rDNA并构建基因文库,经PCR鉴定后从3个文库中分别随机挑取50个阳性克隆进行DNA序列测定。分别对3个文库的测序结果进行分析发现,除去24.00%~32.00%为无法鉴定的未培养细菌和未分类细菌以外,其余细菌来自于芽胞杆菌纲、γ-变形菌纲、放线菌纲和黄杆菌纲,分别占各文库克隆总数的38.00%~42.00%、20.00%~26.00%、4.00%~8.00%和0~2.00%。除去44株无法鉴定的细菌,进一步对其他106株细菌进行分析发现,其中2株放线菌目细菌和5株肠杆菌科细菌无法进一步鉴定,其余99个菌株包含了来自19个属的至少30种细菌,且肠球菌属、变形杆菌属和芽胞杆菌属为其中的优势菌属。本研究显示冷冻原肠浸泡解冻池水中细菌多样性较高,其中部分细菌为致病菌和条件致病菌。

关 键 词:冷冻原肠  解冻池  细菌多样性  16S  rDNA文库

Analysis of Bacterial Diversity in Thawing Pool Water of Frozen Intestines
QIU Bao-feng,SONG Hong-yan,DONG Rong-lian,GAO Xue-mei,JIANG Ying-mei,GU Bing-quan,HU Shun-lin.Analysis of Bacterial Diversity in Thawing Pool Water of Frozen Intestines[J].Progress In Veterinary Medicine,2017,38(5).
Authors:QIU Bao-feng  SONG Hong-yan  DONG Rong-lian  GAO Xue-mei  JIANG Ying-mei  GU Bing-quan  HU Shun-lin
Abstract:
Keywords:
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