| 陕西省部分地区PRRSV流行毒株ORF3和ORF5基因的遗传变异分析 |
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| 引用本文： | 徐丽美,付明哲,何亚鹏,许信刚,于三科,张琪.陕西省部分地区PRRSV流行毒株ORF3和ORF5基因的遗传变异分析[J].动物医学进展,2017,38(6). |
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| 作者姓名： | 徐丽美 付明哲 何亚鹏 许信刚 于三科 张琪 |
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| 作者单位： | 西北农林科技大学动物医学院,陕西杨凌,712100 |
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| 基金项目： | 陕西省农业科技创新与攻关项目，西北农林科技大学基本科研业务费项目 |
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| 摘 要： | 为了解陕西省猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)流行毒株的遗传和变异情况,对9份疑似感染PRRSV的病料用RT-PCR方法分别扩增ORF3和ORF5基因,并进行测序和序列分析。测序结果表明,ORF3基因在254-490和646-737位置之间发生不连续碱基突变;与GenBank已发表的国外毒株ORF3基因组比较,同源性为89.2%~94.8%,与国内发表的ORF3基因比较,同源性为88.8%~99.0%,其中与2009年陕西分离株(HQ843181.1)同源性为94.9%~98.7%,与2010年陕西株(KJ855518.1)同源性为94.9%~98.6%。ORF5基因突变主要在508-600碱基位置之间,与GenBank上已发表的国外毒株ORF5基因组比较,同源性为90.1%~92.1%,与国内发表的ORF5基因比较,同源性为89.6%~99.2%,其中与2009年陕西分离株(HQ843181.1)同源性为95.2%~98.4%,与2010年陕西株(KJ855518.1)同源性为95.2%~98.7%。ORF3和ORF5基因进化树中Wn-2、Ak-3和Tc-4毒株在同一个进化支上,之间亲缘关系近,Xy-1和Hz-5毒株分别在不同的进化分支上,与其他毒株遗传距离较远。陕西省PRRSV流行毒株的ORF5和ORF3基因组与国内PRRSV分离株相比较均有一定变异,且亲缘进化不完全相同。
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| 关 键 词： | 猪繁殖与呼吸综合征病毒 ORF3基因 ORF5基因 序列分析 |
Genetic Variation Analysis of ORF3 and ORF5 genes of Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus in Partial Regions of Shaanxi Province |
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| XU Li-mei,FU Ming-zhe,HE Ya-peng,XU Xin-gang,YU San-ke,ZHANG Qi.Genetic Variation Analysis of ORF3 and ORF5 genes of Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus in Partial Regions of Shaanxi Province[J].Progress In Veterinary Medicine,2017,38(6). |
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| Authors: | XU Li-mei FU Ming-zhe HE Ya-peng XU Xin-gang YU San-ke ZHANG Qi |
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