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传染性胰脏坏死病毒实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立及应用
引用本文:张 文,徐立蒲,吕晓楠,王小亮,曹 欢,王 姝,王静波,王 澎.传染性胰脏坏死病毒实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立及应用[J].中国动物检疫,2023,40(4):106-113.
作者姓名:张 文  徐立蒲  吕晓楠  王小亮  曹 欢  王 姝  王静波  王 澎
作者单位:北京市水产技术推广站
基金项目:现代农业产业技术体系北京市渔业创新团队项目(BAIC07-2022-09);国家标准修订项目(IPN诊断规程)
摘    要:传染性胰脏坏死病毒(infectious pancreatic necrosis virus,IPNV)是一种严重危害鲑鳟鱼类的重要传染性病原。为建立IPNV快速检测方法,根据IPNV VP2蛋白编码基因保守序列,设计并筛选出特异性引物和Taq Man探针,并优化筛选引物以及探针检测浓度、退火温度和退火时间,建立了一种实时荧光定量RT-PCR检测方法,并对方法进行了评价。结果显示:该方法灵敏度高,对IPNV的检测限为5 copies/μL;特异性强,对传染性造血器官坏死病毒、鲤春病毒血症病毒、病毒性出血性败血症病毒、草鱼呼肠孤病毒、流行性造血器官坏死病毒等其他病毒核酸扩增均呈阴性;重复性良好,组内与组间重复平均变异系数均小于3%;用本研究建立的实时荧光定量RT-PCR方法,对40份经病毒分离鉴定的样品进行IPNV检测,符合率为100%。结果表明,本研究建立的方法具有快速、特异、敏感等优点,可检测病毒含量较低的组织样品,对于IPNV的快速检测更具优势。

关 键 词:传染性胰脏坏死病毒  实时荧光定量RT-PCR  TaqMan探针

Establishment and Application of a Real-time Fluorescence RT-PCR for Infectious Pancreatic Necrosis Virus
Abstract:
Keywords:
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