| 我国部分地区鸡贫血病病毒全基因组核苷酸序列的比较与分析 |
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| 引用本文： | 梁智选,杨汉春.我国部分地区鸡贫血病病毒全基因组核苷酸序列的比较与分析[J].中国预防兽医学报,2008,30(2):127-131. |
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| 作者姓名： | 梁智选 杨汉春 |
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| 作者单位： | 1. 中国农业大学,动物医学学院,北京,100094;天津市禽病诊断培训中心,天津,300402
2. 中国农业大学,动物医学学院,北京,100094 |
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| 摘 要： | 本研究测定了3个鸡贫血病病毒（Chinken anemia virus，CAV）国内分离株及12个直接来源于临床样品的CAV毒株全基因组序列，结果表明15个CAV毒株的全基因组长度和结构与已报道的其它CAV毒株一致，长度均为2298nt，包含有3个重叠的ORFs。与GenBank发表的13个毒株序列进行序列比较发现，所有毒株核苷酸序列的相似性在95．2％～99．5％之间，CAV全基因组序列有2个高度变异区（HVR），分别位于1033nt～1470nt和1858nt～2193nt。CAVORF3变异度最高，其5’端2／5处和3’端2／5～1／5处为2个高度变异区。ORF2变异度也较高，主要出现在5’端1／4处，ORFI最为保守。以CAV全基因组核苷酸序列和ORF3核苷酸序列为基础分别构建的CAV毒株分子进化树，均可以将全部CAV毒株划分为2个基因群。我国部分地区分离的大多数毒株，属基因Ⅰ群，与德国Cux-1等主要流行毒株有较为相近的亲缘关系；其它CAV国内毒株，属基因Ⅱ群，与日本G6株和TR20株有着更为相近的关系。
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| 关 键 词： | 鸡贫血病病毒 核苷酸序列 分子进化树 地区 鸡贫血病 病毒 全基因组核苷酸序列 序列比较 分析 regions chicken anemia virus nucleotide sequences complete analysis 亲缘关系 日本 流行毒株 德国 分离 基因群 划分 分子进化树 变异度 |
| 文章编号： | 1008-0589（2008）02-0127-05 |
| 收稿时间： | 2007-05-08 |
| 修稿时间： | 2007年5月8日 |
Comparison and analysis of the complete genomic nucleotide sequences of chicken anemia virus isolates from some regions of China |
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| LIANG Zhi-xuan,YANG Han-chun.Comparison and analysis of the complete genomic nucleotide sequences of chicken anemia virus isolates from some regions of China[J].Chinese Journal of Preventive Veterinary Medicine,2008,30(2):127-131. |
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| Authors: | LIANG Zhi-xuan YANG Han-chun |
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