| 气肿疽梭菌细胞毒素CctA基因的克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 云巾宴,任春宇,车达,金清洙,段雪岩,司唯,金鑫.气肿疽梭菌细胞毒素CctA基因的克隆及生物信息学分析[J].吉林农业科学,2015(1):82-85. |
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| 作者姓名： | 云巾宴 任春宇 车达 金清洙 段雪岩 司唯 金鑫 |
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| 作者单位： | 延边大学农学院动物医学系;延边州畜牧总站;延边州动物疫病预防控制中心;延吉市动物卫生监督所 |
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| 基金项目： | 吉林省教育厅“十二五”科学技术研究项目(吉教科合字[2014]第6号) |
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| 摘 要： | 根据GenBank中气肿疽梭菌细胞毒素CctA基因的参考序列,采用PCR方法扩增细胞毒素CctA基因。在将该基因进行克隆和测序后利用生物信息学方法,对细胞毒素CctA蛋白的理化性质、结构功能域、蛋白质二级结构和三级结构及抗原表位等重要参数进行了预测和分析。结果表明:与参考序列(JQ692583)相比,存在3处突变,核苷酸序列的同源性和氨基酸序列的同源性均为99.4%;CctA蛋白的理论等电点为8.00,不存在跨膜区和信号肽序列,二级结构以β-折叠和无规则卷曲为主,主要有4个抗原表位区域。本研究为CctA蛋白功能的深入研究提供了参考,并为气肿疽梭菌单克隆抗体的制备及合成肽疫苗的研发奠定了基础。
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| 关 键 词： | 气肿疽梭菌 细胞毒素CctA基因 克隆 序列分析 |
Cloning and Bioinformatics Analysis of Cytotoxic CctA gene in Clostridium chauvoei |
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| YUN Jin-yan;REN Chun-yu;CHE Da;JIN Qing-zhu;DUAN Xue-yan;SI Wei;JIN Xin.Cloning and Bioinformatics Analysis of Cytotoxic CctA gene in Clostridium chauvoei[J].Jilin Agricultural Sciences,2015(1):82-85. |
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| Authors: | YUN Jin-yan;REN Chun-yu;CHE Da;JIN Qing-zhu;DUAN Xue-yan;SI Wei;JIN Xin |
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| Institution: | YUN Jin-yan;REN Chun-yu;CHE Da;JIN Qing-zhu;DUAN Xue-yan;SI Wei;JIN Xin;Department of Veterinary Medicine, Agricultural College of Yanbian University;Animal Husbandry Station of Yanbian Autonomous Prefecture;Animal Disease Prevention and Control Center of Yanbian;Animal Health Inspection of Yanji; |
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