枯萎病菌诱导感、抗陆地棉品种的转录因子表达变化 |
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引用本文: | 韩泽刚,赵曾强,何兰兰,柴蒙亮,李会会,张薇.枯萎病菌诱导感、抗陆地棉品种的转录因子表达变化[J].作物学报,2015,41(2):228-239. |
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作者姓名: | 韩泽刚 赵曾强 何兰兰 柴蒙亮 李会会 张薇 |
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作者单位: | 1 石河子大学农学院, 新疆石河子 832000; 2 石河子大学生命科学学院, 新疆石河子 832000 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目,国家转基因生物新品种培育重大专项(2011ZX08005-005)资助。 |
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摘 要: | 以陆地棉抗病品种中棉所12和感病品种新陆早7号为材料,利用Solexa高通量测序技术调查枯萎病菌诱导后不同时间感、抗陆地棉品种转录因子家族及转录因子的表达情况。结果表明,枯萎病菌诱导后,抗病品种中棉所12有39个转录因子家族的433个转录因子在至少一个比对组中表达活性发生变化;感病品种新陆早7号则有52个转录因子家族的588个转录因子在至少一个比对组中表达活性发生变化。新陆早7号对枯萎病菌响应的转录因子及转录因子家族的数目明显多于中棉所12,且2个品种的下调基因数目均多于上调基因。随着枯萎病菌诱导后时间延长,两品种对枯萎病菌诱导响应的转录因子家族及转录因子数量均呈现先增加后降低的变化趋势,中棉所12在枯萎病菌诱导后6 h达最多,而新陆早7号在诱导后3 h达最多。在6个比对组中,表达活性均发生变化的重叠转录因子,中棉所12中有9个,隶属于6个转录因子家族;新陆早7号中有31个,隶属于17个转录因子家族。不同抗病性品种对枯萎病的响应有较强的品种特异性,除37个共有的转录因子家族外,2个转录因子家族是中棉所12所特有,15个转录因子家族是新陆早7号所特有。
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关 键 词: | 陆地棉 枯萎病 Solexa测序 转录因子 |
收稿时间: | 2014-05-27 |
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