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四川凉山州3个黑绵羊群体Prdm9基因锌指序列的比较研究
引用本文:张芬芬,黄卫平,黄林,金素钰,郑玉才.四川凉山州3个黑绵羊群体Prdm9基因锌指序列的比较研究[J].华北农学报,2023(S1):408-412.
作者姓名:张芬芬  黄卫平  黄林  金素钰  郑玉才
作者单位:1. 西南民族大学畜牧兽医学院;2. 四川省凉山彝族自治州畜牧科学研究所
摘    要:旨在通过测定Prdm9基因锌指域序列,探索四川3个黑绵羊群体间的亲缘关系。采集黑绵羊群体抗凝全血,提取基因组DNA,用PCR特异扩增Prdm9基因锌指域,进一步通过克隆测序以分析遗传多样性。结果显示,黑绵羊中鉴定出存在9种锌指,锌指间存在1~5个氨基酸差异,共构成5种Prdm9锌指域,分别定义为不同的等位基因(A、B、C、D和E),其中A~D包含8个锌指,这是试验黑绵羊Prdm9锌指域的主要类型,E包含9个锌指且仅发现于盐源黑绵羊中,其等位基因频率仅为0.050。这些等位基因形成6种基因型,包括AA、AC、BB、BD、CC和EE,在布拖黑绵羊和普格黑绵羊中均检测到4种基因型,而盐源黑绵羊中有6种,且BB和EE仅在该群体中观察到。Prdm9的等位基因频率和PIC值在3个黑绵羊群体中存在不同程度差异,有较丰富的遗传多态性,其中盐源黑绵羊相对最丰富。3个黑绵羊群体Prdm9锌指域的等位基因频率分布均极显著偏离哈代-温伯格平衡(P<0.01),提示它们在育种中受到较大的人工选择影响。综上所述,黑绵羊群体中Prdm9有较丰富的遗传多样性,3个群体间亲缘关系均较近。

关 键 词:黑绵羊  Prdm9  锌指  克隆测序  亲缘关系
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