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猪源冠状病毒监测简报
引用本文:董雅琴,张慧,张锋,刘爽,崔进,李晓成,魏荣.猪源冠状病毒监测简报[J].中国动物检疫,2020,37(3):1-2.
作者姓名:董雅琴  张慧  张锋  刘爽  崔进  李晓成  魏荣
基金项目:国家重点研发计划项目(2017YFC1200500);2019-nCoV溯源和传播途径研究项目(2020YFC0840800)
摘    要:目前,已知感染猪群的冠状病毒有6种,分别是猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)、猪呼吸道冠状病毒(PRCV)、猪急性腹泻综合征冠状病毒(SADS-CoV)、猪血凝性脑脊髓炎病毒(PHEV)和猪δ冠状病毒(PDCoV)。在冠状病毒科α、β、γ、δ等4个属中,PEDV、TGEV、PRCV、SADS-CoV均为α冠状病毒,PHEV为β冠状病毒,PDCoV为δ冠状病毒。PRCV在临床上引发仔猪呼吸道症状,PHEV感染会造成仔猪呕吐和神经症状,其他4种病毒均可引起猪群腹泻。中国动物卫生与流行病学中心对2011年以来收集自全国16个省份的2 915份临床腹泻猪群样品(肠道、粪便等)进行了PEDV、TGEV检测,检出PEDV阳性1 223份、TGEV阳性109份,PEDV、TGEV检出率分别为41.96%、3.74%;对2014年以来收集自14个省份的12 430份临床健康猪组织样品(淋巴结、扁桃体等)进行了PEDV检测,检出阳性325份,检出率为2.61%。针对引发新型冠状病毒肺炎的病原2019新型冠状病毒(2019-nCoV),对2018—2019年收集自15个省份的2 658份生猪组织样品开展了追溯性检测,结果均为阴性。对2019-nCoV与猪源冠状病毒的亲缘关系进行了分析。基于全基因组的遗传进化分析表明:2019-nCoV与同为β冠状病毒属的PHEV核苷酸同源性仅为54%,与α、δ属猪源冠状病毒亲缘关系更远。基于以上数据与分析,可初步排除2019-nCoV来源于已知猪源冠状病毒的可能性。

关 键 词:猪源冠状病毒  2019新型冠状病毒  追溯性检测

Brief Report on the Surveillance of Swine-origin Coronaviruses
Dong Yaqin,Zhang Hui,Zhang Feng,Liu Shuang,Cui Jin,Li Xiaocheng,Wei Rong.Brief Report on the Surveillance of Swine-origin Coronaviruses[J].China Journal Of Animal Quarantine,2020,37(3):1-2.
Authors:Dong Yaqin  Zhang Hui  Zhang Feng  Liu Shuang  Cui Jin  Li Xiaocheng  Wei Rong
Abstract:
Keywords:
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