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十字花科植物HSP22基因同源序列的克隆与进化分析
引用本文:程影,黄锐之,钟新民,侯喜林,吴学龙,王五宏,李必元,刘智宏.十字花科植物HSP22基因同源序列的克隆与进化分析[J].南京农业大学学报,2012,35(4):41-46.
作者姓名:程影  黄锐之  钟新民  侯喜林  吴学龙  王五宏  李必元  刘智宏
作者单位:1. 南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室,江苏南京210095;浙江省农业科学院蔬菜研究所
2. 浙江省农业科学院病毒学与生物技术研究所/浙江省植物代谢基因工程试验基地,浙江杭州,310021
3. 浙江省农业科学院蔬菜研究所
4. 南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室,江苏南京,210095
基金项目:国家863计划项目,浙江省农业科学院科技创新项目
摘    要:采用PCR克隆技术,根据已报道的拟南芥的AtHSP22基因全长及其他物种同源序列设计特异引物,在十字花科植物大白菜、普通白菜、芥菜型油菜、甘蓝型油菜、花椰菜、芥菜、荠菜、萝卜3个属10个物种中成功克隆得到耐热相关基因HSP22的同源序列10条。序列比对分析表明:这些同源序列的相似性达89.3%以上,所推导的氨基酸序列相似性达92.1%以上。由进化树可直观地看出,芸薹属与荠属亲缘关系最近,首先聚为一类;其次与萝卜属、拟南芥属聚为一类。由氨基酸序列预测的高级结构存在明显差异,且无规则卷曲最多,α-螺旋均在30%以上,因而属于α结构蛋白。

关 键 词:十字花科植物  HSP22基因  克隆  进化分析

Cloning and evolutionary analysis of homologous sequences of HSP22 gene in Cruciferae
CHENG Ying , HUANG Rui-zhi , ZHONG Xin-min , HOU Xi-lin , WU Xue-long , WANG Wu-hong , LI Bi-yuan , LIU Zhi-hong.Cloning and evolutionary analysis of homologous sequences of HSP22 gene in Cruciferae[J].Journal of Nanjing Agricultural University,2012,35(4):41-46.
Authors:CHENG Ying  HUANG Rui-zhi  ZHONG Xin-min  HOU Xi-lin  WU Xue-long  WANG Wu-hong  LI Bi-yuan  LIU Zhi-hong
Institution:1.State Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement,Nanjing Agricultural University,Nanjing 210095,China; 2.Institute of Vegetable Sciences,3.Institute of Virology and Biotechnology/Key Laboratory of Plant Metabolic Engineering of Zhejiang Province,Zhejiang Academy of Agricultural Sciences,Hangzhou 310021,China)
Abstract:
Keywords:
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