| 基于HRM技术的草鱼抗小瓜虫nlrc3基因SNP标记开发及关联分析 |
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| 引用本文： | 陈锋,黄梦璐,李家乐,沈玉帮.基于HRM技术的草鱼抗小瓜虫nlrc3基因SNP标记开发及关联分析[J].上海海洋大学学报,2024,33(1):1-8. |
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| 作者姓名： | 陈锋 黄梦璐 李家乐 沈玉帮 |
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| 作者单位： | 上海海洋大学 农业农村部淡水水产种质资源重点实验室,上海海洋大学 农业农村部淡水水产种质资源重点实验室,上海海洋大学 农业农村部淡水水产种质资源重点实验室,上海海洋大学 农业农村部淡水水产种质资源重点实验室 |
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| 基金项目： | 财政部和农业农村部：国家现代农业产业技术体系(CARS-45-03) |
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| 摘 要： | 为探究草鱼nlrc3基因的多态性和抗多子小瓜虫（Ichthyophthirius multifiliis）病之间的关联性，通过多子小瓜虫感染草鱼（Ctenopharyngodon idella）筛选出易感群体和抗病群体，并分析比较两个群体nlrc3基因的单核苷酸多态性（Single nucleotide polymorphism, SNP）位点，使用高分辨率熔解（High resolution melt, HRM）和Sanger测序技术验证SNP位点基因型，并将获得的SNP位点与草鱼抗病性状进行关联性分析。结果显示，从草鱼nlrc3基因中筛选得到了4个SNPs位点，有3个SNPs位点（SNP1、SNP3和SNP4）成功分型，其中SNP1和SNP3中分别含有AA、AG和AA、GG两种基因型，且与抗多子小瓜虫性状显著相关；倍型组合及其与抗病能力相关性分析显示，与其他二倍型相比，由SNP1的AG和SNP3的AA基因型组成的二倍型（D1）中100%为抗病个体，由SNP1的AG与SNP3的GG基因型组成的二倍型（D2）中95%为抗病个体，均为抗病优势基因型。研究表明，抗小瓜虫的草鱼全体中存在nl...
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| 关 键 词： | 草鱼 多子小瓜虫 高分辨率熔解 单核苷酸多态性 |
| 收稿时间： | 2023/3/12 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2023/5/23 0:00:00 |
Development and Characterization of SNPs in Grass Carp Resistance Genes to White Grub Based on HRM Technology |
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| Chen Feng,Huang Menglu,Li Jiale and Shen Yubang.Development and Characterization of SNPs in Grass Carp Resistance Genes to White Grub Based on HRM Technology[J].Journal of Shanghai Ocean University,2024,33(1):1-8. |
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| Authors: | Chen Feng Huang Menglu Li Jiale and Shen Yubang |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Grass carp Ichthyophthirius multifiliis HRM SNP |
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