| 基于线粒体 Cytb基因和D-loop区的鸭绿江流域细鳞鱼群体遗传多样性 |
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| 引用本文： | 王丹丹,宋 洁,王 旭,乐海梅.基于线粒体 Cytb基因和D-loop区的鸭绿江流域细鳞鱼群体遗传多样性[J].西北农业学报,2023(11):1675-1685. |
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| 作者姓名： | 王丹丹 宋 洁 王 旭 乐海梅 |
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| 作者单位： | (辽东学院 鸭绿江流域研究院，辽宁丹东 118000) |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金（32272757）；辽宁省自然科学基金（2022-NLTS-15-04）；辽东学院鸭绿江流域研究院开放课题（YLJ20220104）。 |
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| 摘 要： | 旨在研究鸭绿江流域（丹东段）细鳞鱼野生群体与养殖群体的遗传多样性，并探究其种质资源情况。基于细鳞鱼线粒体DNA Cytb基因和D-loop区序列，对宽甸（KD）和丹东江域（DD）2个野生细鳞鱼群体和 1个养殖群体的遗传结构与遗传多样性等进行比较研究。结果表明： Cytb基因1 141 bp，A+T含量 53.55%，G+C含量46.45%，D-loop区序列988 bp，A+T含量62.75%，G＋C含量37.25%；基于Cytb和D-loop序列在90个样本中分别检测到42和 56个多态性位点，定义了21和26种单倍型，其中KD、DD和YZ群体 Cytb基因的单倍型数分别为14、10和 7，KD、DD和YZ群体D-loop区单倍型数分别为16、15和10；遗传多样性分析 Cytb基因表现出高单倍型多样性（0.986）和低核苷酸多样性（0.004 66），而D-loop区表现出高单倍型多样性（0.981）和高水平的核苷酸多样性（0.019 82），基于 Cytb基因和D-loop区序列KD和DD群体分别具有4个和2个相同单倍型，说明2个细鳞鱼野生群体间的分化程度较小，而养殖群体与野生群体间遗传分化为中度；分子方差分析（AMOVA）发现群体内部的遗传变异（Cytb：73.38%；D-loop：85.91%）占比明显高于群体间的遗传变异（Cytb：26.62%；D-loop：14.09%），表明鸭绿江流域（丹东段）细鳞鱼群体遗传变异主要来源于群体内，不同地理群体间的遗传变异不大；群体单倍型系统发育树表明，KD、DD和YZ群体间互有交叉，均未表现出明显的地理聚集，3个群体间尚未出现明显的地理谱系结构，结果与遗传多样性研究一致。Tajima’s D和Fu and Li’s中性检验显著偏离中性，推测细鳞鱼KD和DD群体可能经历过群体扩张事件，随后处于相对平衡稳定状态。
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| 关 键 词： | 鸭绿江流域 细鳞鱼 Cytb基因 D-loop区 群体遗传多样性 |
Genetic Diversity of Brachymystax lenok Based on Mitochondrial Cytb Gene and D-loop Region from Yalu River Basin |
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| ZHANG Tao,ZHOU Jianguang,ZHANG Lin,GAN Jinhua and HE Li.Genetic Diversity of Brachymystax lenok Based on Mitochondrial Cytb Gene and D-loop Region from Yalu River Basin[J].Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica,2023(11):1675-1685. |
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| Authors: | ZHANG Tao ZHOU Jianguang ZHANG Lin GAN Jinhua and HE Li |
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| Institution: | WANG Dandan,SONG Jie,WANG Xu and LE Haimei |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Yalu River basin Brachymystax lenok Cytb gene D-loop region Population genetic diversity |
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