| 16个高丛越橘品种VcCBF基因的单核苷酸多态性(SNP)分析 |
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| 引用本文： | 王甲威,林科,姜超,魏海蓉,刘庆忠.16个高丛越橘品种VcCBF基因的单核苷酸多态性(SNP)分析[J].东北农业大学学报,2012(10):41-44. |
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| 作者姓名： | 王甲威 林科 姜超 魏海蓉 刘庆忠 |
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| 作者单位： | 1. 山东省果树研究所,山东省果树生物技术育种重点实验室,山东 泰安 271000
2. 泰山学院生物与酿酒工程学院,山东 泰安 271021 |
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| 基金项目： | 公益性行业(农业)科研专项(201103037) |
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| 摘 要： | CBF是与植物抗寒、抗旱等抗逆性相关的一种转录因子,在植物抵抗逆境过程中发挥重要作用.以16个高丛越橘品种为试材,采用直接测序法克隆VcCBF基因,共克隆到94个非重复序列,对这些序列进行单核苷酸多态性分析,测序总长度63732 bp,共发现103个SNP,单核苷酸多态性发生频率为1/619 bp,核苷酸多态性值(Pi)为0.01274.在103个SNP中,单态突变位点为52个,简约信息位点为51个,其中双突变为50个,三态突变为1个.通过碱基转换方式的分析发现,转换共83个,颠换19个,转换与颠换的发生比率为4.37 1.通过单倍型分析发现在16个越橘品种中VcCBF基因存在5种单倍型.
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| 关 键 词： | CBF 单核苷酸多态性(SNP) 越橘 |
Single nucleotide polymorphism of VcCBF gene in 16 highbush blueberry varieties |
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| WANG Jiawei,LIN Ke,JIANG Chao,WEI Hairong,LIU Qingzhong.Single nucleotide polymorphism of VcCBF gene in 16 highbush blueberry varieties[J].Journal of Northeast Agricultural University,2012(10):41-44. |
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| Authors: | WANG Jiawei LIN Ke JIANG Chao WEI Hairong LIU Qingzhong |
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| Institution: | 1(1.Shandong Institute of Pomology,Key Laboratory for Fruit Biotechnology Breeding of Shandong,Taian Shandong 271000,China;2.Taishan University,School of Biology and Brewing Engineering,Taian Shandong 271021,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | CBF single nucleotide polymorphism(SNP) blueberry |
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