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梨果黑斑病菌磷酸二酯酶PDE基因克隆及其在侵染结构分化中的表达分析
引用本文:毛仁燕,蒋倩倩,李永才,毕阳,刘勇翔,黄怡,张苗.梨果黑斑病菌磷酸二酯酶PDE基因克隆及其在侵染结构分化中的表达分析[J].核农学报,2022,36(4):728-737.
作者姓名:毛仁燕  蒋倩倩  李永才  毕阳  刘勇翔  黄怡  张苗
作者单位:甘肃农业大学食品科学与工程学院,甘肃 兰州 730070
基金项目:国家自然科学基金项目(31860456);
摘    要:磷酸二酯酶(PDE)能够特异地催化cAMP/cGMP 3', 5'环磷酸的3'环磷酸键水解,调节胞内cAMP水平,进而调控致病真菌的生长发育,但PDE基因在梨果黑斑病菌中的具体调控机制有待研究。本研究采用反转录PCR(RT-PCR)克隆了梨果黑斑病菌Alternaria alternata中的PDELPDEH基因;通过TMHMM、ProtScale、SOPMA等在线分析工具对AaPDELAaPDEH基因及其编码蛋白进行生物信息学分析;采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术分析了PDELPDEH基因在梨果黑斑病菌侵染结构分化过程中的表达特性。克隆得到梨果黑斑病菌PDELPDEH,分别命名为AaPDELAaPDEH,蛋白编码区(CDS)长度分别为3 132和2 886 bp,分别编码1 043和961个氨基酸。生物信息学分析表明AaPDEL和AaPDEH均属于不稳定亲水蛋白,不含信号肽也无跨膜结构,均具有多个磷酸化位点,分别定位于线粒体和细胞核上;AaPDEL和AaPDEH分别具有Class Ⅱ型和Ⅰ型保守催化结构域。系统分析结果表明,AaPDEL和AaPDEH与小麦褐斑病菌(Pyrenophora tritici-repentis)和番茄匍柄霉(Stemphylium lycopersici)亲缘关系最近,同源性分别高达79.25%和88.80%。qRT-PCR结果显示,疏水性诱导,A. alternata侵染结构分化过程中,AaPDELAaPDEH基因在附着胞形成阶段(6 h)表达量显著提高,较萌发初期阶段(2 h)分别上调1.19和1.97倍,表明AaPDELAaPDEHA. alternata侵染结构分化中具有重要的调控作用。本研究为进一步从分子水平揭示PDE调控机制奠定了基础。

关 键 词:梨果黑斑病菌  磷酸二酯酶  生物信息学分析  侵染结构分化  表达特性  
收稿时间:2021-04-25

Cloning and Expression Analysis of Phosphodiesterase PDE Gene in Infection Structure Differentiation of Alternaria alternata
MAO Renyan,JIANG Qianqian,LI Yongcai,BI Yang,LIU Yongxiang,HUANG Yi,ZHANG Miao.Cloning and Expression Analysis of Phosphodiesterase PDE Gene in Infection Structure Differentiation of Alternaria alternata[J].Acta Agriculturae Nucleatae Sinica,2022,36(4):728-737.
Authors:MAO Renyan  JIANG Qianqian  LI Yongcai  BI Yang  LIU Yongxiang  HUANG Yi  ZHANG Miao
Institution:College of Food Science and Engineering, Gansu Agricultural University, Lanzhou, Gansu 730070
Abstract:
Keywords:Alternaria alternata  phosphodiesterase  bioinformatics analysis  structure differentiation of infection  expression characteristics  
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