| 低海拔与高海拔斑头雁肺脏的比较转录组学分析 |
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| 引用本文： | 候建平,郑思思,朱丽琳,赵文信,何顺福,王稳.低海拔与高海拔斑头雁肺脏的比较转录组学分析[J].畜牧与兽医,2022(1):1-7. |
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| 作者姓名： | 候建平 郑思思 朱丽琳 赵文信 何顺福 王稳 |
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| 作者单位： | 青海大学省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室;西宁市野生动物疫源疫病监测站 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金地区科学基金(31960277);国家自然科学基金国际(地区)合作与交流项目(32111530018,21-54-53031);青海省自然科学基金青年项目(2018-ZJ-932Q);省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室自主课题(2017-ZZ-21)。 |
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| 摘 要： | 为探究高低海拔斑头雁肺脏差异表达基因和差异代谢通路的变化,基于Illumina NovaSeq 6000测序平台对斑头雁肺脏组织进行转录组测序,分析差异表达基因,利用荧光定量PCR对部分差异表达基因进行验证,进一步对差异表达基因进行GO功能富集分析和KEGG信号通路富集分析。结果:与高海拔组斑头雁肺脏相比,筛选出差异表达基因84个,其中上调差异表达基因51个,下调差异表达基因33个。经GO功能注释后富集到21个显著性GO功能,"生物过程"显著富集到11个条目,涉及代谢过程以及内源性刺激的应答等。"细胞组成"显著富集到1个条目,涉及到细胞外区域。"分子功能"显著富集到9个条目,涉及到酶活性、激素、转录因子、钠离子跨膜转运等。注释到KEGG的显著性富集通路有3条,涉及到糖胺聚糖降解通路、丝裂原活化蛋白激酶信号通路以及丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢通路。本研究结果丰富了斑头雁的基因资源,为该物种海拔适应相关基因的功能研究奠定了基础。
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| 关 键 词： | 斑头雁 肺脏 转录组 低海拔 高海拔 |
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