| 西瓜bHLH转录因子家族基因的鉴定及其在非生物胁迫下的表达分析 |
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| 引用本文： | 何洁,顾秀容,魏春华,杨小振,李好,马建祥,张勇,杨建强,张显.西瓜bHLH转录因子家族基因的鉴定及其在非生物胁迫下的表达分析[J].园艺学报,2016,43(2):281-294. |
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| 作者姓名： | 何洁 顾秀容 魏春华 杨小振 李好 马建祥 张勇 杨建强 张显 |
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| 作者单位： | 西北农林科技大学园艺学院，陕西杨凌 712100 |
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| 基金项目： | 国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目(CARS-26-18) |
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| 摘 要： | 利用生物信息学方法,在西瓜测序基因组97103中共鉴定出96个bHLH家族成员,其中有94个可以被定位到西瓜的11条染色体上。通过基因结构和结构域序列保守性的预测,发现这些基因的序列长度和内含子数量变化很大,但bHLH结构域序列比较保守。用拟南芥中39条已知的bHLH蛋白序列和西瓜的96条bHLH蛋白序列构建系统发育树,结果显示西瓜的bHLH家族可以进一步被分为11个亚族。运用荧光定量实时PCR技术,分析了该家族中21个基因在西瓜响应非生物胁迫时的表达水平,结果表明,8个基因受低温胁迫诱导表达,13个基因受ABA胁迫诱导表达,14个基因受盐胁迫诱导表达。ClabHLH41在3种胁迫下表达量均显著增加,说明其在低温、ABA和盐胁迫应答中可能发挥着重要作用。
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| 关 键 词： | 西瓜 bHLH 全基因组鉴定 胁迫响应 基因表达 |
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