| 家蚕B型清道夫受体基因的鉴定及系统发生与表达分析 |
| |
| 引用本文： | 董占鹏,柴春利,代方银,潘敏慧,杜周和,胡海,鲁成.家蚕B型清道夫受体基因的鉴定及系统发生与表达分析[J].蚕业科学,2010,36(5):743-753. |
| |
| 作者姓名： | 董占鹏 柴春利 代方银 潘敏慧 杜周和 胡海 鲁成 |
| |
| 作者单位： | 西南大学蚕学与系统生物学研究所,重庆,400716;云南省农业科学院蚕桑蜜蜂研究所,云南蒙自,661101;西南大学生物技术学院,重庆,400716;西南大学蚕学与系统生物学研究所,重庆,400716;西南大学生物技术学院,重庆,400716;四川省农业科学院蚕业研究所,四川南充,637000;西南大学蚕学与系统生物学研究所,重庆,400716 |
| |
| 基金项目： | 国家重点基础研究发展计划"973"项目，农业部引进国际先进农业科学技术计划"948"项目 |
| |
| 摘 要： | B型清道夫受体(SR-B)是清道夫受体超基因家族成员,参与机体的脂类代谢、动脉粥样硬化形成或保护、宿主免疫损害防御、凋亡细胞清除和细胞粘附等重要生命过程。基于家蚕全基因组数据,利用比较基因组学方法,鉴定获得了14个家蚕B型清道夫受体基因,这些基因分布在至少5条染色体上,其内含子的大小从几十到近万个碱基对。系统发生分析表明,14个家蚕B型清道夫受体基因分布在3个类群:第1类群中分布的9个基因和第3类群中分布的3个基因,分别与类群中其它昆虫的同源基因形成明显的直系同源关系;第2类群中分布有2个基因,此类群中不同昆虫的同源基因之间的进化关系较为复杂。EST数据和芯片数据分析表明,多数家蚕B型清道夫受体基因具有转录活性。RT-PCR检测结果显示,有8个家蚕B型清道夫受体基因在5龄第3天幼虫组织中表达,并具有不同的表达模式,推测这些基因可能行使不同的功能。研究结果为进一步诠释家蚕B型清道夫受体基因的功能奠定了基础。
|
| 关 键 词： | 家蚕 B型清道夫受体基因 生物信息学分析 系统发生 组织表达 |
Identification, Phylogenetic and Expressional Analyses of Class B Scavenger Receptor Genes in Silkworm, Bombyx mori |
| |
| DONG Zhan-Peng,CHAI Chun-Li,DAI Fang-Yin,PAN Min-Hui,DU Zhou-He,HU Hai,LU Cheng.Identification, Phylogenetic and Expressional Analyses of Class B Scavenger Receptor Genes in Silkworm, Bombyx mori[J].Acta Sericologica Sinica,2010,36(5):743-753. |
| |
| Authors: | DONG Zhan-Peng CHAI Chun-Li DAI Fang-Yin PAN Min-Hui DU Zhou-He HU Hai LU Cheng |
| |
| Institution: | DONG Zhan-Peng1,2 CHAI Chun-Li3 DAI Fang-Yin1,3 PAN Min-Hui1,3 DU Zhou-He4 HU Hai1 LU Cheng1,3(1Institute of Sericulture and Systems Biology,Southwest University,Chongqing 400716,China,2Sericultural and Api-cultural Research Institute,Yunnan Academy of Agricultural Sciences,Mengzi Yunnan 661101,3College of Bio-technology,4The Sericultural Research Institute,Sichuan Academy of Agricultural Sciences,Nanchong Sichuan 637000,China) |
| |
| Abstract: | The class B scavenger receptor(SR-B) genes,one of the members of scavenger receptor supergene family,participate in a range of important life processes of organism,such as lipid metabolism,formation or protection of athero-sclerosis,defence of host innate immunity,clearance of apoptotic cells,and cell adhesion etc.Based on data of the silkworm(Bombyx mori) whole genome,we identified 14 putative SR-B genes of silkworm by means of comparative ge-nomic analysis.These genes are distributed on at least 5 chromos... |
| |
| Keywords: | Bombyx mori Class B scavenger receptor gene Bioinformatic analysis Phylogenesis Tissue expression |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ |
|
