首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
     检索      

乏情和发情初产母猪卵巢microRNA差异表达分析
引用本文:任巧玲,白献晓,王璟,郭红霞,陈俊峰,马文涛,和小娥,张家庆,邢宝松.乏情和发情初产母猪卵巢microRNA差异表达分析[J].中国畜牧兽医,2018(5).
作者姓名:任巧玲  白献晓  王璟  郭红霞  陈俊峰  马文涛  和小娥  张家庆  邢宝松
作者单位:河南省农业科学院畜牧兽医研究所;河南省动物卫生监督所;郑州市动物卫生监督所
摘    要:为了探索卵巢microRNA(miRNA)在初产母猪生殖调控中的作用,本研究利用Illumina高通量测序技术检测了乏情和发情初产母猪卵巢miRNA的表达谱,并对表达量较高且差异显著的miRNA进行生物信息学分析。结果显示,本研究构建的两个small RNA文库共鉴定出503个miRNAs,其中已知的303个,新预测的200个。在已知的miRNA中,ssc-miR-10b在两个文库中的表达量最高,其次为ssc-miR-143-3p和ssc-miR-26a;在新预测的miRNA中,chr13_2637_mature在两个文库中的表达量最高,其次为chr8_9994_mature。与发情母猪相比,共有145个miRNAs发生显著变化(read counts10,∣log2(fold-change)∣1),上调114个,下调31个。在进一步筛选的31个表达量较高且差异显著的miRNAs(read counts1 000,∣log2(fold-change)∣1)中,新预测的chr13_2585_mature上调倍数最高,且只在乏情母猪卵巢中表达。31个miRNAs共预测到7 388个靶基因,KEGG信号通路分析显示,有2 788个靶基因注释到了297个KEGG通路,前20个最富集的通路部分与生殖过程或生殖活动调控相关,表明这31个miRNAs参与了初产母猪的生殖调控。本研究结果丰富了猪miRNA数据资源,为进一步深入研究初产母猪的繁殖性能提供了理论依据。

本文献已被 CNKI 等数据库收录!
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号