| 基于RNA-Seq技术挖掘绵羊背最长肌肉质性状相关基因 |
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| 引用本文： | 王位,付绍印,何小龙,王艳欣,王月星,王标,刘斌,刘永斌,张文广.基于RNA-Seq技术挖掘绵羊背最长肌肉质性状相关基因[J].中国畜牧兽医,2018(1). |
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| 作者姓名： | 王位 付绍印 何小龙 王艳欣 王月星 王标 刘斌 刘永斌 张文广 |
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| 作者单位： | 内蒙古农业大学动物科学学院;动物遗传育种与繁殖内蒙古自治区重点实验室;内蒙古自治区农牧业科学院;内蒙古ATCG生物信息研究所;内蒙古犇牛科技有限公司; |
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| 摘 要： | 试验通过对小尾寒羊与巴美肉羊背最长肌进行转录组分析,旨在挖掘影响两种绵羊肉质性状的关键基因。分别选取小尾寒羊和巴美肉羊各3只,利用转录组高通量测序(RNA-Seq)技术对其背最长肌转录组文库进行测序,利用生物信息学对测序结果进行分析,筛选影响两者肉质相关的候选基因。结果发现,6个样品测序数据经质量控制后共得到120Gb的有效数据,共筛选出333个差异基因,其中上调基因有82个,下调基因有251个。GO功能富集与KEGG Pathway显著性富集分析结果共筛选了6个与肉质性状相关的候选基因:PDK4、MYF6、PPARGC1A、SLCO4A1、FABP4、LEP。试验通过对比小尾寒羊与巴美肉羊背最长肌转录组数据,筛选影响肉质性状的候选基因,丰富了绵羊基因组信息,为进一步阐述不同品种绵羊肉质性状分子机理奠定了基础。
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