| 从江香猪γ干扰素基因克隆与序列分析 |
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| 引用本文： | 温贵兰,陈绍品,张升波,林汉卿,管国丹,王开功,文明,周碧君,程振涛,赵德刚.从江香猪γ干扰素基因克隆与序列分析[J].中国畜牧兽医,2018(6). |
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| 作者姓名： | 温贵兰 陈绍品 张升波 林汉卿 管国丹 王开功 文明 周碧君 程振涛 赵德刚 |
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| 作者单位： | 贵州大学农业生物工程研究院贵州大学生命科学学院山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室;贵州大学动物科学学院预防兽医实验室;贵州省农业科学院 |
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| 摘 要： | 试验旨在研究从江香猪γ干扰素(interferon gamma,IFN-γ)基因克隆与序列分析。试验提取贵州从江香猪肝脏组织总RNA,反转录生成cDNA,采用2对特异性引物进行巢式PCR扩增从江香猪IFN-γ(CJ-poIFN-γ)基因编码区,将其克隆至pUCm-T载体上,获得重组质粒pUCm-CJpoIFN-γ,并测序鉴定;利用NCBI、SOPMA、SignalP-4.1等在线服务器软件、DNAStar软件对CJ-poIFN-γ进行序列分析。结果表明,CJ-poIFN-γ基因编码区长501bp,编码166个氨基酸;核苷酸序列比对结果显示,CJ-poIFN-γ与梅山猪、剑白猪、藏猪、成华猪、荣昌猪、印度猪、长白猪、内江猪同源性为99.4%~100.0%;进化树分析结果显示,CJ-poIFN-γ与梅山猪、剑白猪、藏猪、成华猪亲缘关系较近;CJ-poIFN-γ基因编码蛋白不存在跨膜结构,为分泌蛋白,前23个氨基酸为信号肽序列;CJ-poIFN-γ基因编码蛋白二级结构主要以α-螺旋(50.60%)和无规则卷曲(33.14%)为主,B细胞表位主要位于62-65、84-87、113-115、144-156和162-166位氨基酸。试验结果为进一步研究IFN-γ的生物活性、加快从江香猪品种资源的有效利用奠定基础。
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