摩拉水牛二酰甘油酰基转移酶2基因的多态性检测 |
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引用本文: | 鄢胜飞,尚江华,黄丽华,杨春艳,郑海英,李孟琪,于农淇,Mahmoud Moussa,覃广胜,黄加祥,张秀芳.摩拉水牛二酰甘油酰基转移酶2基因的多态性检测[J].中国畜牧兽医,2018(10). |
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作者姓名: | 鄢胜飞 尚江华 黄丽华 杨春艳 郑海英 李孟琪 于农淇 Mahmoud Moussa 覃广胜 黄加祥 张秀芳 |
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作者单位: | 中国农业科学院广西水牛研究所广西水牛遗传繁育重点实验室;广西职业技术学院 |
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摘 要: | 本研究旨在检测水牛二酰甘油酰基转移酶2(diacylglycerolacylt-ransferase,DGAT2)基因的单核苷酸多态性(SNP),探究摩拉水牛多态性位点的群体遗传特征。以广西水牛研究所的57头摩拉水牛为材料,PCR扩增DGAT2基因的部分序列(外显子2及内含子2、3),通过常规测序法检测其SNP,并运用遗传多样性分析软件(POPGENE)和SPSS软件对群体的多态性位点进行基因频率、基因型频率、多态信息含量(PIC)、有效等位基因数(Ne)及遗传杂合度(He)的检测。结果表明,在摩拉水牛DGAT2基因外显子2和内含子2、3上共发现了9个SNPs位点(IVS2.54GA、IVS2.158AG、EVS2.191AG、EVS2.228AG、IVS3.311CT、IVS3.444AG、IVS3.451AC、IVS3.466CT、IVS3.521CT),其中EVS2.191AG位点的突变导致氨基酸由异亮氨酸突变为缬氨酸,突变位点间存在一定程度的连锁遗传但接近连锁平衡状态。从基因频率上看,IVS2.158AG、EVS2.191AG、IVS3.311CT、IVS3.451AC、IVS3.466CT和IVS3.521CT 6个SNPs位点的两个等位基因频率有较大差异,提示等位基因频率较大的基因个体可能更适合生存。9个SNPs位点在摩拉水牛品种上多处于高度多态,杂合度在0.1744~0.4975之间,说明摩拉水牛群体中DGAT2基因遗传多态性丰富,具有较大的育种价值和性状改良潜力。
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