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室内培育不同产地卤虫的成虫肠道菌群结构分析
引用本文:茹文红,段亚飞,郑晓婷,董宏标,刘青松,张家松.室内培育不同产地卤虫的成虫肠道菌群结构分析[J].南方农业学报,2018,49(9):1841-1848.
作者姓名:茹文红  段亚飞  郑晓婷  董宏标  刘青松  张家松
作者单位:中国水产科学研究院 南海水产研究所/农业农村部南海渔业资源开发利用重点实验室,广州 510300上海海洋大学水产与生命学院,上海 201306中国水产科学研究院 南海水产研究所/农业农村部南海渔业资源开发利用重点实验室,广州,510300根特大学 水产养殖和卤虫研究中心,比利时 根特 9000
摘    要:目的]探究室内培育卤虫的成虫肠道菌群组成及结构特征,为开展人工健康养殖卤虫提供参考依据.方法]选取俄罗斯鄂木斯克地区及我国巴里坤和渤海湾产地的卤虫卵进行孵化,人工养殖至成虫期后采用16S rDNA高通量测序技术分析不同产地卤虫肠道内的菌群组成及结构特征.结果]Illumina MiSeq测序共得到481096条有效序列,平均每个样品有53455条有效序列.变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和厚壁菌门(Firmicutes)为不同产地卤虫肠道内的优势菌群,其在肠道菌群内的相对丰度均在97.0%以上.不同产地卤虫肠道菌群的共有OTU为291个,共有OTU对应序列数占不同产地卤虫总序列数的95.04%.其中,假单胞杆菌属(Pseudomonas)有29个OTUs,其对应序列数占总序列数的31.25%;盐单胞杆菌属(Halomonas)有15个OTUs,其对应序列数占总序列数的16.44%;交替赤杆菌属(Altererythrobacter)有9个OTUs,其对应序列数占总序列数的12.00%.不同产地的卤虫肠道菌群也存在一定差异,交替赤杆菌属和列文虎克菌属(Leeuwenhoekiella)在俄罗斯鄂木斯克卤虫肠道内的相对丰度显著高于我国巴里坤和渤海湾产地的卤虫(P<0.05,下同),微小杆菌属(Exiguobacterium)在我国巴里坤卤虫肠道内的相对丰度显著高于俄罗斯鄂木斯克地区和我国渤海湾产地的卤虫,而Idiomarina属仅在我国渤海湾卤虫肠道菌群中出现.结论]卤虫肠道菌群构成与其生存的水体环境和摄食的饵料相关,因此可通过调整养殖水体环境和投喂饵料的一致性以提高肠道共有菌群的比例.卤虫肠道中参与食物消化吸收的有益菌群可作为今后研究卤虫生长机制的靶菌群.

关 键 词:卤虫    肠道    菌群结构    不同产地    成虫期

Structure of intestinal tract bacterial communities of adult Artemia parthenogenetica from different producing areas under indoor culture
RU Wen-hong,DUAN Ya-fei,ZHENG Xiao-ting,DONG Hong-biao,LIU Qing-song,ZHANG Jia-song.Structure of intestinal tract bacterial communities of adult Artemia parthenogenetica from different producing areas under indoor culture[J].Journal of Southern Agriculture,2018,49(9):1841-1848.
Authors:RU Wen-hong  DUAN Ya-fei  ZHENG Xiao-ting  DONG Hong-biao  LIU Qing-song  ZHANG Jia-song
Abstract:
Keywords:
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