水稻RR基因家族生物信息学及表达模式分析 |
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引用本文: | 陈明迪,胡桂花,张海文,王旺田.水稻RR基因家族生物信息学及表达模式分析[J].中国农业科技导报,2024(5):20-29. |
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作者姓名: | 陈明迪 胡桂花 张海文 王旺田 |
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作者单位: | 1. 甘肃农业大学生命科学技术学院;2. 中国农业科学院生物技术研究所 |
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基金项目: | 中国农业科学院科技创新工程项目; |
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摘 要: | 水稻反应调节因子(response regulators,RR)家族在植物生长发育中扮演着重要角色,探究RR基因在水稻中的进化及生物学特征具有重要意义。水稻RR基因家族共有22个成员,包含15个A型和7个B型基因。分析发现,水稻RR蛋白的理化性质存在差异,其中B型均为亲水蛋白(GRAVY<0);水稻RR基因有5个旁系基因对,分别为OsRR8和OsRR15、OsRR5和OsRR11、OsRR9和OsRR10、OsRR1和OsRR2、OsRR20与OsRR18,预测其与已知功能基因具有相似的功能;保守基序Motif 1与Motif 3均属于REC超级家族,作为响应调节器接收来自双组分磷酸转移系统中的信号传导,在22个OsRR蛋白中均有分布。调控元件与表达模式分析表明,RR基因具有调控脱落酸、水杨酸、茉莉酸、赤霉素与生长素等多种信号转导的潜能,参与植物防御低温、干旱等胁迫及光和厌氧等信号响应过程,同时也具有调控水稻不同组织生长发育的功能。通过对水稻RR基因进行生物信息学分析,为后续深入研究水稻RR家族成员的功能提供理论依据,也为进一步揭示植物生长发育及信号传导机制奠定了基础。
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关 键 词: | 水稻 RR家族 生物信息学 表达模式分析 |
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