大白菜KASP反应体系的优化与建立 |
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引用本文: | 杨双娟,原玉香,魏小春,王志勇,赵艳艳,姚秋菊,张晓伟.大白菜KASP反应体系的优化与建立[J].园艺学报,2018,45(12):2442-2452. |
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作者姓名: | 杨双娟 原玉香 魏小春 王志勇 赵艳艳 姚秋菊 张晓伟 |
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作者单位: | 河南省农业科学院园艺研究所,郑州 450002 |
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基金项目: | 国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目(CARS-23-G-16);农业部黄淮海(河南)蔬菜观测站项目(10205020);河南省科技攻关项目(182102110438);河南省农业科学院自主创新项目(2018ZC30) |
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摘 要: | 以大白菜基因组DNA为模板,对影响竞争性等位基因特异性PCR(Kompetitive allele specific PCR,KASP)的反应体积、引物浓度和DNA模板用量等3个参数进行优化,建立了适用于大白菜的KASP反应体系。96孔模块最佳反应体系中,总反应体积为8 μL,其中模板DNA(60 ~ 80 ng · μL-1)1 μL,KASP Master mix(2×)4 μL,引物混合物(50 μmol · L-1)0.14 μL,ddH2O 3 μL。384孔模块最佳反应体系中,总反应体积为4 μL,其中模板DNA(60 ~ 80 ng · μL-1)1 μL,KASP Master mix(2×)2 μL,引物混合物(50 μmol · L-1)0.07 μL,ddH2O 1 μL。利用不同引物和不同的大白菜材料对优化的反应体系进行验证,均获得了较好的KASP-SNP分型,验证了该优化体系的稳定性。该反应体系可以用于大白菜遗传多样性研究、基因定位、遗传图谱构建等遗传学研究。
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关 键 词: | 大白菜 KASP 反应体系优化 |
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