| 利用siRNA高通量测序和RT-PCR技术鉴定引起茄子斑驳紫花病的病毒种类 |
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| 引用本文： | 柴阿丽,陈利达,曹金强,康华军,石延霞,谢学文,李宝聚.利用siRNA高通量测序和RT-PCR技术鉴定引起茄子斑驳紫花病的病毒种类[J].园艺学报,2019,46(3):508-518. |
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| 作者姓名： | 柴阿丽 陈利达 曹金强 康华军 石延霞 谢学文 李宝聚 |
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| 作者单位： | （中国农业科学院蔬菜花卉研究所，北京100081） |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划项目(2016YFD0201000);中国农业科学院科技创新工程项目(CAAS-ASTIP-IVFCAAS);农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室项目 |
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| 摘 要： | 为了明确引起茄子斑驳紫花病的病毒种类,利用小干扰RNA(si RNA)高通量测序技术,结合生物信息学方法寻找茄子样本中的病毒序列,发现存在烟草轻型绿花叶病毒(Tobacco mild green mosaic virus,TMGMV)和番茄斑驳花叶病毒(Tomato mottle mosaic virus,ToMMV)。为了验证该结果,对待测样品中TMGMV和ToMMV的外壳蛋白(coatprotein,CP)全长基因进行RT-PCR扩增和系统进化分析,分别得到500bp的TMGMV-CP和482bp的ToMMV-CP特异性条带,与GenBank中TMGMV和ToMMV序列相似性分别达到98%～100%和100%,说明待测样品中确实存在TMGMV和ToMMV。对采自山东、河南、辽宁、河北等地的23份疑似斑驳紫花病茄子样品,分别采用特异性引物524-F/R和ToMMV-F/R进行检测。结果显示,所有样品中均含有TMGMV,20份样品中含有ToMMV,复合侵染检出率为86.96%。对茄子、番茄和辣椒幼苗的致病性检测显示,接种后茄子花表现出与田间相同的症状,茄子、番茄和辣椒的叶片表现典型的病毒侵染症状,在接种发病组织中检测到病毒ToMMV和TMGMV。结果表明,茄子斑驳紫花病样中鉴定出TMGMV和ToMMV两种病毒。
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| 关 键 词： | 茄子斑驳紫花病 siRNA高通量测序 分子鉴定 烟草轻型绿花叶病毒 番茄斑驳花叶病毒 |
Identification of Viruses Causing Eggplant Purple Mottle Flower Disease by siRNA High-throughput Sequencing and RT-PCR detection |
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| CHAI Ali,CHEN Lida,CAO Jinqiang,KANG Huajun,SHI Yanxia,XIE Xuewen,LI Baoju.Identification of Viruses Causing Eggplant Purple Mottle Flower Disease by siRNA High-throughput Sequencing and RT-PCR detection[J].Acta Horticulturae Sinica,2019,46(3):508-518. |
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| Authors: | CHAI Ali CHEN Lida CAO Jinqiang KANG Huajun SHI Yanxia XIE Xuewen LI Baoju |
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| Institution: | （Institute of Vegetables and Flowers，Chinese Academy of Agricultural Sciences，Beijing 100081，China） |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | eggplant purple mottle virus disease siRNA high-throughput sequencing molecular identification Tobacco mild green mosaic virus Tomato mottle mosaic virus |
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