| 基于转录组学测序的长白落叶松材性表达基因1） |
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| 引用本文： | 赵佳丽,张磊,张素芳,王艳红,张含国.基于转录组学测序的长白落叶松材性表达基因1）[J].东北林业大学学报,2016(4):8-12. |
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| 作者姓名： | 赵佳丽 张磊 张素芳 王艳红 张含国 |
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| 作者单位： | 林木遗传育种国家重点实验室 东北林业大学，哈尔滨，150040 |
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| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划(863计划) |
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| 摘 要： | 基于边合成边测序（ Sequencing By Synthesis ，SBS）技术，使用Illumina HiSeq2500高通量测序平台对长白落叶松cDNA文库进行测序。共获得非重复序列基因58683条，总长度为55283938 bp。将得到的转录本使用BLAST软件将非重复序列基因序列与NR、Swiss－Prot、GO、COG、KEGG数据库比对，通过选择BLAST参数E－value不大于10－5，最终获得29350个有注释信息的基因序列，其中19292个转录本注释GO编号，有9112个转录本在COG数据库中被注释并分为25个功能分类，同时注释到120条KEGG代谢途径。在得到注释的转录本中搜索到木质素相关基因共68条，其中与木质素合成相关基因29条，与木质素分解代谢相关基因27条；找到了147条纤维素相关基因，其中与纤维素合成相关基因103条，与纤维素分解代谢相关基因44条。
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| 关 键 词： | 长白落叶松 转录组 高通量测序 材性基因 |
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