| 东北虎源犬瘟热病毒H基因生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 江峰,王昊宁,黄利亚,王晓龙.东北虎源犬瘟热病毒H基因生物信息学分析[J].经济动物学报,2018(1). |
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| 作者姓名： | 江峰 王昊宁 黄利亚 王晓龙 |
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| 作者单位： | 东北林业大学野生动物资源学院;东北林业大学保护医学与生态安全研究中心;长白山科学研究院; |
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| 摘 要： | 从GenBank数据库下载犬瘟热病毒14种基因型H基因237株序列,与3株东北虎源犬瘟热病毒序列比对之后进行同源性和位点变异分析,最后构建系统发育树。研究发现:3株东北虎源犬瘟热病毒(KC579362、KC579363和KM386683)分别属于Arctic-like和Asia-1基因型,与其他基因型毒株的同源性为89.94%~100%之间,H基因序列1 632(G→A)、1 664(C→T)、1 729(G→A)和1 795(G→A)位点的突变可能是CDV跨宿主传播给东北虎的关键突变位点。Arctic-like和Asia-1型毒株对东北虎威胁最大,H基因变异位点可为研究东北虎源序列遗传变异特征提供分子生物学依据。
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| 关 键 词： | 犬瘟热病毒 东北虎 H基因 基因型 位点变异 |
Bioinformatics Analysis of H Gene of Canine Distemper Virus in Amur Tiger |
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