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牦牛mtDNA编码蛋白质的基因密码子偏好性研究及聚类分析
引用本文:徐利娟,钟金城,杨万远,马志杰,穆 松,姬秋梅,张成福.牦牛mtDNA编码蛋白质的基因密码子偏好性研究及聚类分析[J].西北农业学报,2010,19(6):13-17.
作者姓名:徐利娟  钟金城  杨万远  马志杰  穆 松  姬秋梅  张成福
作者单位:1. 西南民族大学,动物遗传育种学国家民委-教育部共建重点实验室,成都,610041
2. 青海大学畜牧兽医科学院,西宁,810016
3. 西藏农业科学院,畜牧兽医研究所,拉萨,850000
摘    要:对牦牛线粒体DNA(mtDNA)编码蛋白质的基因序列进行分析,探讨基因序列密码子的使用模式和特性,并根据基因序列和密码子的偏好性对牦牛与其他物种间的进化关系进行聚类分析。结果表明,牦牛mtDNA编码蛋白质的基因偏爱使用碱基A以及以A结尾的密码子,UUC、UAC、CAC、CAA等28个密码子为牦牛mtDNA编码蛋白质基因的偏好性密码子。家牦牛与野牦牛亲缘关系最近,首先聚为一类,然后依次与其他牛、山羊、绵羊等物种相聚。

关 键 词:牦牛  密码子偏好性  聚类分析

Codon Usage Bias Studies and Cluster Analysis on Protein Coding Genes of mtDNA in Bos grunniens
XU Lijuan,ZHONG Jincheng,YANG Wanyuan,MA Zhijie,MU Song,JI Qiumei and ZHANG Chengfu.Codon Usage Bias Studies and Cluster Analysis on Protein Coding Genes of mtDNA in Bos grunniens[J].Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica,2010,19(6):13-17.
Authors:XU Lijuan  ZHONG Jincheng  YANG Wanyuan  MA Zhijie  MU Song  JI Qiumei and ZHANG Chengfu
Abstract:
Keywords:mtDNA
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