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FMDV Asia1/HeB病毒株结构蛋白基因的克隆测序及B细胞抗原表位预测
引用本文:张中旺,张永光,王永录,潘丽,方玉珍,刘力宽,蒋守田,吕建亮,周鹏,张昱,张淑刚,杜进鑫,李正丰.FMDV Asia1/HeB病毒株结构蛋白基因的克隆测序及B细胞抗原表位预测[J].华北农学报,2009,24(4).
作者姓名:张中旺  张永光  王永录  潘丽  方玉珍  刘力宽  蒋守田  吕建亮  周鹏  张昱  张淑刚  杜进鑫  李正丰
作者单位:中国农业科学院,兰州兽医研究所,家畜疫病病原生物学国家重点实验室,农业部畜禽病毒学重点开放实验室,甘肃,兰州,730046
摘    要:对口蹄疫病毒Asia1/HeB株P1结构蛋白基因进行了扩增、克隆及序列测定.采用DNAStar Protean软件对P1蛋白的二级结构、可塑性、亲水性、表面可及性及抗原指数等参数进行分析,综合预测其B细胞表位分布.结果表明,FMDV Asia I/HeB株P1基因长2 199 bp,包含完整的开放阅读框,编码733个氨基酸,其中VP1长633 bp,编码211个氨基酸,VP2长654 bp,编码218个氨基酸,VP3长657 bp,编码219个氨基酸,VP4长255 bp,编码85个氨基酸.P1结构蛋白的二级结构较为复杂,含有较多的β片层结构和转角结构,VP1、VP2和VP3上均有多个区域为B细胞优势表位,VP4上也有少量的潜在B细胞表位.与已鉴定的B细胞表位相比较,该方法预测的结果有较高的准确度.为试验确定FMDV AsiaI/HeB株P1结构蛋白的B细胞表位和反向疫苗学设计提供了理论基础.

关 键 词:口蹄疫病毒  结构蛋白  测序  B细胞表位

Cloning,Sequencing and B Cell Epitopes Prediction of Structural Protein Gene of a Foot-and-Mouth Disease Virus Strain Asia1/HeB
ZHANG Zhong-wang,ZHANG Yong-guang,WANG Yong-lu,PAN Li,FANG Yu-zhen,LIU Li-kuan,JIANG Shou-tian,LU Jian-liang,ZHOU Peng,ZHANG Yu,ZHANG Shu-gang,DU Jin-xin,LI Zheng-feng.Cloning,Sequencing and B Cell Epitopes Prediction of Structural Protein Gene of a Foot-and-Mouth Disease Virus Strain Asia1/HeB[J].Acta Agriculturae Boreali-Sinica,2009,24(4).
Authors:ZHANG Zhong-wang  ZHANG Yong-guang  WANG Yong-lu  PAN Li  FANG Yu-zhen  LIU Li-kuan  JIANG Shou-tian  LU Jian-liang  ZHOU Peng  ZHANG Yu  ZHANG Shu-gang  DU Jin-xin  LI Zheng-feng
Abstract:
Keywords:
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