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玉米天冬氨酸蛋白酶基因家族的鉴定与表达分析
引用本文:程相杰,徐莉萍,母小焕,苟明月.玉米天冬氨酸蛋白酶基因家族的鉴定与表达分析[J].玉米科学,2022,30(1):53-62.
作者姓名:程相杰  徐莉萍  母小焕  苟明月
作者单位:河南农业大学农学院/省部共建小麦玉米作物学国家重点实验室, 郑州 450046
基金项目:NSFC-河南联合基金项目(U2004207)、河南省“中原千人计划”中原青年拔尖人才项目(ZYQR201912168)、河南省重点研发与推广专项-科技攻关项目(192102110018)
摘    要:以玉米B73基因组为参考序列,在全基因组水平系统分析玉米天冬氨酸蛋白酶家族成员的基因组结构信息,深入了解玉米天冬氨酸蛋白酶家族基因(ZmAPs)的生物学功能。结果表明,总共鉴定出75个ZmAPs,通过系统进化树分析将ZmAPs分为两大亚组,同一亚组之间的motif分布与基因结构都相对保守。染色体定位和共线性分析发现,ZmAPs不均匀地分布在玉米的10条染色体上,其中,7对为串联重复基因。对其启动子顺式作用元件分析后发现,ZmAPs可能参与光响应、MeJA及ABA等信号通路。对生物与非生物胁迫下的玉米转录组表达谱分析发现,ZmAPs对生物胁迫的响应更为强烈,表明ZmAPs可能参与玉米抗病的过程。

关 键 词:玉米  天冬氨酸蛋白酶  生物信息学分析  表达谱分析
收稿时间:2021/3/16 0:00:00

Genome-Wide Identification and Expression Analysis of Aspartic Protease Family in Maize
CHENG Xiang-jie,XU Li-ping,MU Xiao-huan,GOU Ming-yue.Genome-Wide Identification and Expression Analysis of Aspartic Protease Family in Maize[J].Journal of Maize Sciences,2022,30(1):53-62.
Authors:CHENG Xiang-jie  XU Li-ping  MU Xiao-huan  GOU Ming-yue
Institution:College of Agronomy, Henan Agricultural University/National Key Laboratory of Wheat and Maize Crops Science, Zhengzhou 450046, China
Abstract:
Keywords:Maize  Aspartic protease  Bioinformatics analysis  Gene expression analysis
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